RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 KRT26Q7Z3Y9 468 aa13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RIC3Q7Z5B4 369 aa13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 PODXL2Q9NZ53 605 aa13.36□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 PSME4Q14997 1843 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 HUNKP57058 714 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 NOGQ13253 232 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SEC31BQ9NQW1 1179 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 IFT57Q9NWB7 429 aa13.35□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC85CA6NKD9 419 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 VIL1P09327 827 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM161AQ3B820 660 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC191Q8NCU4 936 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ZIC5Q96T25 663 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 MYD88Q99836 296 aa13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF609O15014 1411 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 ADM5C9JUS6 153 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 APAF1O14727 1248 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 UFL1O94874 794 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 GNAI1P63096 354 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC152Q4G0S7 254 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 GGA1Q9UJY5 639 aa13.33□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 PDE8AO60658 829 aa13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 RGMBQ6NW40 437 aa13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 MCOLN1Q9GZU1 580 aa13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 GGA3Q9NZ52 723 aa13.32□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 G3V3G9 751 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 RGS19P49795 217 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 DCAF8Q5TAQ9 597 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 SULF1Q8IWU6 871 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 C8orf58Q8NAV2 365 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 MYH3P11055 1940 aa13.31□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 DDX58O95786 925 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC30Q5VVM6 783 aa13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 AGBL3Q8NEM8 1001 aa13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC102AQ96A19 550 aa13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 XDHP47989 1333 aa13.3□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 AKAP11Q9UKA4 1901 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 CHMP4AQ9BY43 222 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 SPEF2Q9C093 1822 aa13.29□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC10A3P09131 477 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP2B4P23634 1241 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 CTSWP56202 376 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 DGKZQ13574 1117 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 TSPYL6Q8N831 410 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 CDCA5Q96FF9 252 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 GMLQ99445 158 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa13.28□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.27□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.28
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKV5-2P06315 115 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 USP17L8P0C7I0 530 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 SCARF1Q14162 830 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 KSR2Q6VAB6 950 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 PODNQ7Z5L7 613 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.27□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 PI4KAP2A4QPH2 592 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 USP17L3A6NCW0 530 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 USP17L4A6NCW7 530 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 USP17L1Q7RTZ2 530 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 TTLL11Q8NHH1 800 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 MYOZ2Q9NPC6 264 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF186Q9NXI6 227 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 MED23Q9ULK4 1368 aa13.26□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 TRPA1O75762 1119 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 FKBP1BP68106 108 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 RASAL3Q86YV0 1011 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 CSRNP1Q96S65 589 aa13.25□□□□□ -0.29
EFTUD2-226ENST00000593200 GREM2Q9H772 168 aa13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.9 ms