RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592373.1

MED16-208, Transcript of mediator complex subunit 16, humanhuman

TSL 3

Gene MED16, Length 927 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16-208ENST00000592373 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.75■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 SLC51AQ86UW1 340 aa22.75■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 EYA3Q99504 573 aa22.75■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 SPEF2Q9C093 1822 aa22.75■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 RLBP1P12271 317 aa22.74■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 ATP2B4P23634 1241 aa22.74■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 PDE3AQ14432 1141 aa22.74■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.74■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 LARGE2Q8N3Y3 721 aa22.74■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.74■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 POLLQ9UGP5 575 aa22.74■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 GGA1Q9UJY5 639 aa22.74■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.73■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 C6orf229H3BNL8 230 aa22.73■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 PPIP5K2O43314 1243 aa22.73■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 GNAI2P04899 355 aa22.73■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 WASHC4Q2M389 1173 aa22.73■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.73■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.73■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 GLTPD2A6NH11 291 aa22.72■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 FZD9O00144 591 aa22.72■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.72■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 MTX1Q13505 466 aa22.71■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 AOC3Q16853 763 aa22.71■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 NIM1KQ8IY84 436 aa22.71■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 FBXO3Q9UK99 471 aa22.71■■□□□ 1.23
MED16-208ENST00000592373 UFL1O94874 794 aa22.7■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 CHRNDQ07001 517 aa22.7■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 PANK1Q8TE04 598 aa22.7■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.7■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP22.69■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 ZNRF3Q9ULT6 936 aa22.69■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.69■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.68■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 PLIN1O60240 522 aa22.68■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 EIF6P56537 245 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.68■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 MED23Q9ULK4 1368 aa22.66■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.66■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 COL4A5P29400 1685 aa22.66■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 GPC2Q8N158 579 aa22.65■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 COPRSQ9NQ92 184 aa22.65■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 A0A1B0GUL6 1792 aa22.64■■□□□ 1.22
MED16-208ENST00000592373 EYA2O00167 538 aa22.64■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 RIMBP2O15034 1052 aa22.64■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 CIAO1O76071 339 aa22.64■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 KCNJ4P48050 445 aa22.64■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 SRGAP3O43295 1099 aa22.63■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 UBE4AQ14139 1066 aa22.63■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 WDR90Q96KV7 1748 aa22.62■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 G3V3G9 751 aa22.62■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 TAF5LO75529 589 aa22.62■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 TNIP1Q15025 636 aa22.62■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.62■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 PODNQ7Z5L7 613 aa22.62■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 COG6Q9Y2V7 657 aa22.62■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.61■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 ATP8B2P98198 1209 aa22.61■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 CXCL9Q07325 125 aa22.61■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 LRRC24Q50LG9 513 aa22.61■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.61■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 ECE2O60344 883 aa22.6■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 PDE8BO95263 885 aa22.6■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 METTL24Q5JXM2 366 aa22.6■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.6■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.6■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 COA1Q9GZY4 146 aa22.6■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.6■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 SCN4AP35499 1836 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 YDJCA8MPS7 323 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 DOK7Q18PE1 504 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 SSH3Q8TE77 659 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 RRAGCQ9HB90 399 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.59■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.58■■□□□ 1.21
MED16-208ENST00000592373 POLA2Q14181 598 aa22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms