RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589536.5

GRN-215, Transcript of granulin precursor, human

TSL 3

Gene GRN, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRN-215	ENST00000589536	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	31.35	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	31.35	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	RTL9	Q8NET4	1388 aa		31.34	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	UFL1	O94874	794 aa		31.34	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	DOK7	Q18PE1	504 aa		31.34	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	DPF2	Q92785	391 aa		31.34	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		31.34	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	VAMP4	O75379	141 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	MICALL2	Q8IY33	904 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	GGA1	Q9UJY5	639 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	31.33	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	MYH3	P11055	1940 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		31.33	■■■□□ 2.61
GRN-215	ENST00000589536	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		31.32	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	CST9	Q5W186	159 aa		31.32	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	31.32	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	31.32	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.31	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	SCN9A	Q15858	1988 aa		31.31	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536		H7C1W4	665 aa		31.31	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	31.31	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536		H7C1D1	291 aa		31.3	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		31.3	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	31.3	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	GREM2	Q9H772	168 aa		31.3	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	XDH	P47989	1333 aa		31.29	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	31.29	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	GCKR	Q14397	625 aa		31.29	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	31.29	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		31.28	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.28	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	CASP7	P55210	303 aa		31.27	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	31.26	■■■□□ 2.6
GRN-215	ENST00000589536	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		31.26	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.26	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	31.26	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		31.26	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	FOXN1	O15353	648 aa		31.25	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	31.25	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.25	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		31.25	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	SPEF2	Q9C093	1822 aa		31.25	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	ZNF609	O15014	1411 aa		31.24	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	EGFR	P00533	1210 aa		31.24	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	ATP2B4	P23634	1241 aa		31.24	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		31.24	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	WBP1L	Q9NX94	342 aa		31.24	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		31.23	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	TNS4	Q8IZW8	715 aa		31.23	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		31.23	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	PSME4	Q14997	1843 aa		31.22	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	31.22	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	31.22	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	31.21	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536		G3V3G9	751 aa		31.21	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		31.21	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	CAPNS2	Q96L46	248 aa		31.2	■■■□□ 2.59
GRN-215	ENST00000589536	MED23	Q9ULK4	1368 aa		31.19	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	CSF1R	P07333	972 aa		31.19	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	FAM161A	Q3B820	660 aa		31.19	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		31.19	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		31.19	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	AIDA	Q96BJ3	306 aa		31.19	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	ZNF521	Q96K83	1311 aa		31.19	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536		F6X3S4	739 aa		31.18	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	ITGA6	P23229	1130 aa		31.18	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	ECE1	P42892	770 aa		31.18	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	31.18	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	BEND3	Q5T5X7	828 aa		31.17	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	31.17	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	PODN	Q7Z5L7	613 aa		31.17	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	USP48	Q86UV5	1035 aa		31.17	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	31.16	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		31.16	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	31.16	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		31.16	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	31.15	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		31.15	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	GML	Q99445	158 aa		31.15	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		31.15	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		31.15	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	DLK2	Q6UY11	383 aa		31.14	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		31.14	■■■□□ 2.58
GRN-215	ENST00000589536	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	31.12	■■■□□ 2.57
GRN-215	ENST00000589536	USP17L3	A6NCW0	530 aa		31.12	■■■□□ 2.57
GRN-215	ENST00000589536	USP17L4	A6NCW7	530 aa		31.12	■■■□□ 2.57
GRN-215	ENST00000589536	GRM1	Q13255	1194 aa		31.12	■■■□□ 2.57
GRN-215	ENST00000589536	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		31.12	■■■□□ 2.57
GRN-215	ENST00000589536	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		31.12	■■■□□ 2.57
GRN-215	ENST00000589536	FOXO4	P98177	505 aa		31.11	■■■□□ 2.57
GRN-215	ENST00000589536	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	31.11	■■■□□ 2.57
GRN-215	ENST00000589536	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		31.11	■■■□□ 2.57

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