RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587324.1

UBXN6-204, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 3

Gene UBXN6, Length 712 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-204ENST00000587324 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
UBXN6-204ENST00000587324 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
UBXN6-204ENST00000587324 RGMBQ6NW40 437 aa24.47■■□□□ 1.51
UBXN6-204ENST00000587324 TBC1D16Q8TBP0 767 aa24.47■■□□□ 1.51
UBXN6-204ENST00000587324 SPEF2Q9C093 1822 aa24.47■■□□□ 1.51
UBXN6-204ENST00000587324 RPS12P25398 132 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
UBXN6-204ENST00000587324 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 HOXB7P09629 217 aa24.45■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 RALBP1Q15311 655 aa24.45■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 CFAP44Q96MT7 982 aa24.45■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 SEC31BQ9NQW1 1179 aa24.45■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa24.44■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 GGA3Q9NZ52 723 aa24.44■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF609O15014 1411 aa24.43■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 MYH3P11055 1940 aa24.42■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 RPS8P62241 208 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.42■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 C2orf69Q8N8R5 385 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 RUNDC1Q96C34 613 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 EYA3Q99504 573 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa24.41■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 SLC10A3P09131 477 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 CDCA5Q96FF9 252 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 MBIPQ9NS73 344 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 HYPKQ9NX55 129 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 RNF186Q9NXI6 227 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 SAGE1Q9NXZ1 904 aa24.4■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.5
UBXN6-204ENST00000587324 UFL1O94874 794 aa24.39■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 TRPA1O75762 1119 aa24.38■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC102AQ96A19 550 aa24.38■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 CSRNP1Q96S65 589 aa24.37■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF853P0CG23 659 aa24.36■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 RASAL3Q86YV0 1011 aa24.36■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 SULF1Q8IWU6 871 aa24.36■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 GMLQ99445 158 aa24.36■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.36■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 MYD88Q99836 296 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 GGA1Q9UJY5 639 aa24.35■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 SOX10P56693 466 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 SCARF1Q14162 830 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa24.34■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP24.33■■□□□ 1.49
UBXN6-204ENST00000587324 GOLGA2Q08379 1002 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 MOB2Q70IA6 237 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 AGBL3Q8NEM8 1001 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 HTTP42858 3142 aa24.32■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.31■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC152Q4G0S7 254 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 CCDC191Q8NCU4 936 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 XDHP47989 1333 aa24.3■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 PDE8AO60658 829 aa24.29■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 MYOZ2Q9NPC6 264 aa24.29■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 C8orf58Q8NAV2 365 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 MXD3Q9BW11 206 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa24.28■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 G3V3G9 751 aa24.27■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 USP17L8P0C7I0 530 aa24.27■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 DCAF8Q5TAQ9 597 aa24.27■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa24.27■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 IFT57Q9NWB7 429 aa24.27■■□□□ 1.48
UBXN6-204ENST00000587324 NBPF9Q3BBW0 867 aa24.26■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa24.26■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 MED23Q9ULK4 1368 aa24.26■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 A0A1B0GUL6 1792 aa24.25■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 USP17L3A6NCW0 530 aa24.25■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 USP17L4A6NCW7 530 aa24.25■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 FKBP1BP68106 108 aa24.25■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.25■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.24■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 IGKV5-2P06315 115 aa24.24■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 ATP2B4P23634 1241 aa24.24■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 CTSWP56202 376 aa24.24■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 CENPFP49454 3210 aa24.24■■□□□ 1.47
UBXN6-204ENST00000587324 APAF1O14727 1248 aa24.23■■□□□ 1.47
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