RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRM-210ENST00000578916 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.96□□□□□ -0.49
PTPRM-210ENST00000578916 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
PTPRM-210ENST00000578916 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
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PTPRM-210ENST00000578916 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
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PTPRM-210ENST00000578916 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
PTPRM-210ENST00000578916 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRM-210ENST00000578916 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRM-210ENST00000578916 CFHR5Q9BXR6 569 aa11.85□□□□□ -0.51
PTPRM-210ENST00000578916 HOXB7P09629 217 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRM-210ENST00000578916 PRKG1Q13976 671 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRM-210ENST00000578916 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.84□□□□□ -0.51
PTPRM-210ENST00000578916 FBXW7Q969H0 707 aa11.84□□□□□ -0.51
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