RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578709.5

ERBB2-209, Transcript of erb-b2 receptor tyrosine kinase 2, human

TSL 4

Gene ERBB2, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERBB2-209	ENST00000578709	VPS33B	Q9H267	617 aa		29.72	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	29.72	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	GNAI2	P04899	355 aa		29.7	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
ERBB2-209	ENST00000578709	XDH	P47989	1333 aa		29.7	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	POLL	Q9UGP5	575 aa		29.69	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		29.68	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	29.67	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	MTX1	Q13505	466 aa		29.67	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		29.67	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		29.67	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	GGA1	Q9UJY5	639 aa		29.67	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		29.66	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	COL4A5	P29400	1685 aa		29.66	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	PPIP5K2	O43314	1243 aa		29.65	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	CHRND	Q07001	517 aa		29.65	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		29.65	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		29.65	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	COG6	Q9Y2V7	657 aa		29.65	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	C6orf229	H3BNL8	230 aa		29.64	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	UFL1	O94874	794 aa		29.64	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	ATP2B4	P23634	1241 aa		29.64	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	AOC3	Q16853	763 aa		29.64	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		29.64	■■■□□ 2.34
ERBB2-209	ENST00000578709		A0A1B0GUL6	1792 aa		29.63	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	EYA3	Q99504	573 aa		29.63	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		29.63	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		29.63	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	WASHC4	Q2M389	1173 aa		29.62	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	JDP2	Q8WYK2	163 aa		29.62	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	29.62	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		29.61	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		29.61	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	FZD9	O00144	591 aa		29.6	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	SRGAP3	O43295	1099 aa		29.59	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	LRRC24	Q50LG9	513 aa		29.59	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	NIM1K	Q8IY84	436 aa		29.59	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	29.59	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	29.59	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	29.59	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	FBXO3	Q9UK99	471 aa		29.59	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	29.58	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	COPRS	Q9NQ92	184 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		29.58	■■■□□ 2.33
ERBB2-209	ENST00000578709	MED23	Q9ULK4	1368 aa		29.57	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		29.57	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	EYA2	O00167	538 aa		29.57	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	29.57	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	29.57	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		29.56	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	GLTPD2	A6NH11	291 aa		29.56	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	RIMBP2	O15034	1052 aa		29.56	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	TAF5L	O75529	589 aa		29.56	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	CIAO1	O76071	339 aa		29.56	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	ATP8B2	P98198	1209 aa		29.56	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		29.56	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		29.54	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	POLA2	Q14181	598 aa		29.54	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		29.54	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		29.54	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	29.54	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	KCNJ4	P48050	445 aa		29.53	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	29.53	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		29.53	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	SSH3	Q8TE77	659 aa		29.53	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		29.52	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		29.52	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	29.52	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	METTL24	Q5JXM2	366 aa		29.52	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	CEP85	Q6P2H3	762 aa		29.52	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	SIL1	Q9H173	461 aa		29.52	■■■□□ 2.32
ERBB2-209	ENST00000578709	SNAP23	O00161	211 aa		29.51	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	UBE4A	Q14139	1066 aa		29.51	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		29.51	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	YDJC	A8MPS7	323 aa		29.5	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	ECE2	O60344	883 aa		29.5	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	PDE8B	O95263	885 aa		29.5	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	DOK7	Q18PE1	504 aa		29.5	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		29.5	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	29.5	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	KLRK1	P26718	216 aa		29.49	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	29.49	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	29.49	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	29.48	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	CXCL9	Q07325	125 aa		29.48	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	GPC2	Q8N158	579 aa		29.48	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	WDR90	Q96KV7	1748 aa		29.48	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	SCN9A	Q15858	1988 aa		29.46	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	29.46	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	29.46	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	COA1	Q9GZY4	146 aa		29.46	■■■□□ 2.31

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