RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, humanhuman

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13-223ENST00000577256 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 UFL1O94874 794 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 FSTL1Q12841 308 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 SUCLG2Q96I99 432 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 GJA3Q9Y6H8 435 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 RIMBP2O15034 1052 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 ATP2B4P23634 1241 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 HACL1Q9UJ83 578 aa22.21■■□□□ 1.15
ATG13-223ENST00000577256 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 CXCL9Q07325 125 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 CCDC57Q2TAC2 916 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 USP44Q9H0E7 712 aa22.2■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 KAZALD1Q96I82 304 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.19■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 TNIP1Q15025 636 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 YDJCA8MPS7 323 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 ECE2O60344 883 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 BCAR3O75815 825 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 HSPA6P17066 643 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 G3V3G9 751 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 RAD17O75943 681 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 EPHX2P34913 555 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 MED23Q9ULK4 1368 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 SCNN1DP51172 638 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 CHRNDQ07001 517 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 DOK7Q18PE1 504 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG13-223ENST00000577256 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 LDHDQ86WU2 507 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 ANKRD44Q8N8A2 993 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 TRIM27P14373 513 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 CHADLQ6NUI6 762 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 CNNM1Q9NRU3 951 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 KCNJ4P48050 445 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 A0A1B0GUL6 1792 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 PSMD14O00487 310 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 POTEIP0CG38 1075 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 POTEJP0CG39 1038 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 EPS15P42566 896 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 PODNQ7Z5L7 613 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 SCN9AQ15858 1988 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 APLP1P51693 650 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 PSME4Q14997 1843 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 DPF2Q92785 391 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 TAF5LO75529 589 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 GNAI3P08754 354 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 COA1Q9GZY4 146 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.08■■□□□ 1.13
ATG13-223ENST00000577256 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 MEIS3Q99687 375 aa22.07■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 H7C1D1 291 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 TNNQ9UQP3 1299 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa22.06■■□□□ 1.12
ATG13-223ENST00000577256 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms