RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-202ENST00000572078 HUNKP57058 714 aa17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-202ENST00000572078 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF853P0CG23 659 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-202ENST00000572078 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-202ENST00000572078 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-202ENST00000572078 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-202ENST00000572078 CFAP44Q96MT7 982 aa17.77■□□□□ 0.44
SPNS3-202ENST00000572078 PSME4Q14997 1843 aa17.77■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 CA12O43570 354 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 RGS19P49795 217 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 RPS8P62241 208 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 KRT26Q7Z3Y9 468 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 HYPKQ9NX55 129 aa17.76■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 NOGQ13253 232 aa17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 RPS12P25398 132 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 RGMBQ6NW40 437 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 PODXL2Q9NZ53 605 aa17.74■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 VIL1P09327 827 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 EYA3Q99504 573 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 MYD88Q99836 296 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 GGA3Q9NZ52 723 aa17.73■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF609O15014 1411 aa17.72■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 UFL1O94874 794 aa17.72■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 DGKZQ13574 1117 aa17.72■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 RIC3Q7Z5B4 369 aa17.72■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 SPEF2Q9C093 1822 aa17.71■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 C8orf58Q8NAV2 365 aa17.71■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
SPNS3-202ENST00000572078 SLC34A2O95436 690 aa17.7■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 GOLGA2Q08379 1002 aa17.7■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 CDCA5Q96FF9 252 aa17.7■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 GMLQ99445 158 aa17.7■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 APAF1O14727 1248 aa17.69■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 SLC10A3P09131 477 aa17.69■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 C2orf69Q8N8R5 385 aa17.69■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 IFT57Q9NWB7 429 aa17.69■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa17.69■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 GGA1Q9UJY5 639 aa17.69■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 PDE8AO60658 829 aa17.68■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 SCARF1Q14162 830 aa17.68■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP17.68■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC191Q8NCU4 936 aa17.68■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 RNF186Q9NXI6 227 aa17.68■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 AKAP11Q9UKA4 1901 aa17.67■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC152Q4G0S7 254 aa17.67■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 SULF1Q8IWU6 871 aa17.67■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 TSPYL6Q8N831 410 aa17.67■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 CSRNP1Q96S65 589 aa17.67■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP17.67■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 SAGE1Q9NXZ1 904 aa17.67■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa17.66■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 TRPA1O75762 1119 aa17.66■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 IGKV5-2P06315 115 aa17.66■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 MOB2Q70IA6 237 aa17.66■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 RASAL3Q86YV0 1011 aa17.66■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 AGBL3Q8NEM8 1001 aa17.66■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC102AQ96A19 550 aa17.66■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 MXD3Q9BW11 206 aa17.66■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP17.66■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 XDHP47989 1333 aa17.66■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 MYH3P11055 1940 aa17.65■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 ANP32CO43423 234 aa17.65■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 GNAI1P63096 354 aa17.65■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 MYOZ2Q9NPC6 264 aa17.65■□□□□ 0.42
SPNS3-202ENST00000572078 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa17.64■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa17.64■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 USP17L8P0C7I0 530 aa17.63■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 CTSWP56202 376 aa17.63■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa17.63■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 TTLL11Q8NHH1 800 aa17.63■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 GREM2Q9H772 168 aa17.63■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 G3V3G9 751 aa17.62■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP17.62■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 NBPF9Q3BBW0 867 aa17.62■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 DCAF8Q5TAQ9 597 aa17.62■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 TXNRD3Q86VQ6 643 aa17.62■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 MINPP1Q9UNW1 487 aa17.62■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 MED23Q9ULK4 1368 aa17.62■□□□□ 0.41
SPNS3-202ENST00000572078 PI4KAP2A4QPH2 592 aa17.61■□□□□ 0.41
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