RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.11■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 IFT57Q9NWB7 429 aa20.11■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.11■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 C8orf58Q8NAV2 365 aa20.1■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 PSME4Q14997 1843 aa20.09■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 MAP2K2P36507 400 aa20.09■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 GNAI1P63096 354 aa20.09■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 DPF2Q92785 391 aa20.09■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 EYA3Q99504 573 aa20.09■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 ADM5C9JUS6 153 aa20.08■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 UFL1O94874 794 aa20.08■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 ZIC5Q96T25 663 aa20.08■□□□□ 0.81
NME3-211ENST00000568561 MYH3P11055 1940 aa20.08■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 HUNKP57058 714 aa20.07■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.07■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.07■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.06■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.05■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 TSPYL6Q8N831 410 aa20.05■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.05■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.05■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.04■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 GGA3Q9NZ52 723 aa20.04■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 GGA1Q9UJY5 639 aa20.04■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 G3V3G9 751 aa20.03■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 PDE8AO60658 829 aa20.03■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.03■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa20.03■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 CCDC85CA6NKD9 419 aa20.02■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.02■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
NME3-211ENST00000568561 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 NOGQ13253 232 aa20.01■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 CA12O43570 354 aa20■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 IGKV5-2P06315 115 aa20■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 CCDC184Q52MB2 194 aa20■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 RGMBQ6NW40 437 aa20■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 XDHP47989 1333 aa20■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.99■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 CTSWP56202 376 aa19.99■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 FAM161AQ3B820 660 aa19.99■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP19.99■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.99■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 AKAP11Q9UKA4 1901 aa19.98■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 KSR2Q6VAB6 950 aa19.98■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 G2E3Q7L622 706 aa19.98■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 SULF1Q8IWU6 871 aa19.98■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 C2orf69Q8N8R5 385 aa19.98■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 CDCA5Q96FF9 252 aa19.98■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 MCOLN1Q9GZU1 580 aa19.98■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 ZNF609O15014 1411 aa19.97■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 GREM2Q9H772 168 aa19.97■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 SCARF1Q14162 830 aa19.96■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 AGBL3Q8NEM8 1001 aa19.96■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 TTLL11Q8NHH1 800 aa19.96■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 STK31Q9BXU1 1019 aa19.96■□□□□ 0.79
NME3-211ENST00000568561 ATP2B4P23634 1241 aa19.95■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP19.95■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 GMLQ99445 158 aa19.95■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP19.95■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 MXD3Q9BW11 206 aa19.95■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa19.94■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 USP17L8P0C7I0 530 aa19.94■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 NEXNQ0ZGT2 675 aa19.94■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 DGKZQ13574 1117 aa19.94■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa19.94■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 MYOZ2Q9NPC6 264 aa19.94■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 MINPP1Q9UNW1 487 aa19.94■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 MED23Q9ULK4 1368 aa19.94■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 USP17L3A6NCW0 530 aa19.93■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 USP17L4A6NCW7 530 aa19.93■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 NEURL1BA8MQ27 555 aa19.93■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 SLC10A3P09131 477 aa19.93■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP19.93■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 USP17L1Q7RTZ2 530 aa19.93■□□□□ 0.78
NME3-211ENST00000568561 FBXW7Q969H0 707 aa19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms