RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 G3V3G9 751 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 PSMD14O00487 310 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 ECE2O60344 883 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 VAMP4O75379 141 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.8■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 GGA1Q9UJY5 639 aa26.8■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP26.8■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.8■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 H7C1D1 291 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.79■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 TRAF5O00463 557 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 VEGFBP49765 207 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.78■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 SCN9AQ15858 1988 aa26.78■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 SHTN1A0MZ66 631 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 DEFB115Q30KQ5 88 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 MICALL2Q8IY33 904 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.77■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
PPP4C-211ENST00000567642 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 GREM2Q9H772 168 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.76■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 H7C1W4 665 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 GCKRQ14397 625 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 MYH16Q9H6N6 1097 aa26.75■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 XDHP47989 1333 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 RASSF10A6NK89 507 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 DPF2Q92785 391 aa26.74■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 RTL9Q8NET4 1388 aa26.73■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 PSME4Q14997 1843 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 ATP2B4P23634 1241 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 LINS1Q8NG48 757 aa26.72■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 CST9Q5W186 159 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP4C-211ENST00000567642 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 F6X3S4 739 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 CELF2O95319 508 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.69■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 AIDAQ96BJ3 306 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF408Q9H9D4 720 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.69■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 GRM1Q13255 1194 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 ITGA6P23229 1130 aa26.67■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 CASP7P55210 303 aa26.67■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 FOXN1O15353 648 aa26.66■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 EGFRP00533 1210 aa26.66■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 FAM161AQ3B820 660 aa26.66■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 USP48Q86UV5 1035 aa26.66■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 TNS4Q8IZW8 715 aa26.66■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.66■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 CAPNS2Q96L46 248 aa26.65■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 TLL2Q9Y6L7 1015 aa26.65■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 ECE1P42892 770 aa26.64■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 CYP4F22Q6NT55 531 aa26.64■■□□□ 1.86
PPP4C-211ENST00000567642 CSF1RP07333 972 aa26.63■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa26.63■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 BEND3Q5T5X7 828 aa26.63■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 MED23Q9ULK4 1368 aa26.62■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 PODNQ7Z5L7 613 aa26.62■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 WBP1LQ9NX94 342 aa26.62■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.62■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 USP17L3A6NCW0 530 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 USP17L4A6NCW7 530 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 KRT26Q7Z3Y9 468 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 AGBL3Q8NEM8 1001 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 FBXW7Q969H0 707 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 DLK2Q6UY11 383 aa26.6■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 SAPCD2Q86UD0 394 aa26.6■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.6■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF521Q96K83 1311 aa26.6■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 KCNJ4P48050 445 aa26.58■■□□□ 1.85
PPP4C-211ENST00000567642 FOXO4P98177 505 aa26.58■■□□□ 1.85
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