RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 NLRP3Q96P20 1036 aa21.62■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 A0A1B0GUL6 1792 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 SERPINB2P05120 415 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 FLAD1Q8NFF5 587 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 SLC15A2Q16348 729 aa21.61■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 BOLA2Q9H3K6 86 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 ADORA1P30542 326 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 STK32BQ9NY57 414 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.59■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 ARAP2Q8WZ64 1704 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 CNTROBQ8N137 903 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.58■■□□□ 1.05
HERC2-208ENST00000566635 ATP2B3Q16720 1220 aa21.58■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 MSL1Q68DK7 614 aa21.58■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.58■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 PDE8BO95263 885 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 ATP5JP18859 108 aa21.57■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 ST5P78524 1137 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 NLGN1Q8N2Q7 840 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 XAGE2Q96GT9 111 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 CASC1Q6TDU7 716 aa21.56■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 TAF5LO75529 589 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 CHMLP26374 656 aa21.55■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 SNAP23O00161 211 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 CHRNDQ07001 517 aa21.54■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 TBC1D32Q96NH3 1257 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 MMP10P09238 476 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 FGFR2P21802 821 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 EVI5LQ96CN4 794 aa21.53■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 GORABQ5T7V8 394 aa21.52■■□□□ 1.04
HERC2-208ENST00000566635 HAUS7Q99871 368 aa21.52■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 C22orf23Q9BZE7 217 aa21.52■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 TTC39AQ5SRH9 613 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 IL25Q9H293 177 aa21.51■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 SLC51AQ86UW1 340 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 LPIN2Q92539 896 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 CRY2Q49AN0 593 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 CCDC158Q5M9N0 1113 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.5■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 FSD1Q9BTV5 496 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 SLC5A1P13866 664 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 GRAPQ13588 217 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 SCARF1Q14162 830 aa21.49■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.48■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 PHKA1P46020 1223 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.47■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 GOLIM4O00461 696 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 CCDC125Q86Z20 511 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 SNRKQ9NRH2 765 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 PAG1Q9NWQ8 432 aa21.47■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 CCDC102BQ68D86 513 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 PI16Q6UXB8 463 aa21.46■■□□□ 1.03
HERC2-208ENST00000566635 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 MCAMP43121 646 aa21.45■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 REC8O95072 547 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.44■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 USP26Q9BXU7 913 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 ANTXR1Q9H6X2 564 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 SGSM2O43147 1006 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 CHGBP05060 677 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 RBM25P49756 843 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 FAM227BQ96M60 508 aa21.44■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 ZAP70P43403 619 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 KBTBD3Q8NAB2 608 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 ANO2Q9NQ90 1003 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.43■■□□□ 1.02
HERC2-208ENST00000566635 A0A0D9SFI3 127 aa21.42■■□□□ 1.02
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