RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560067.1

USP3-AS1-205, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene USP3-AS1, Length 366 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.63■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 G3V3G9 751 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATP2B4P23634 1241 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CXCL9Q07325 125 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DCAF8Q5TAQ9 597 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBED9Q6R2W3 1325 aa15.62■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 COL4A5P29400 1685 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 HSPA6P17066 643 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TNIP1Q15025 636 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CCDC57Q2TAC2 916 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 CIAPIN1Q6FI81 312 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 SUCLG2Q96I99 432 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 UTYO14607 1347 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 KIF16BQ96L93 1317 aa15.61■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 COL4A1P02462 1669 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 RAD17O75943 681 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 EPHX2P34913 555 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DOK7Q18PE1 504 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.6■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAF1P21675 1872 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 ECE2O60344 883 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP44Q9H0E7 712 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 WDR90Q96KV7 1748 aa15.59■□□□□ 0.09
USP3-AS1-205ENST00000560067 YDJCA8MPS7 323 aa15.58■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 LDHDQ86WU2 507 aa15.58■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 KAZALD1Q96I82 304 aa15.58■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 LEMD3Q9Y2U8 911 aa15.58■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.58■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 LRRC37AA6NMS7 1700 aa15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 BCAR3O75815 825 aa15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCNJ4P48050 445 aa15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 SCNN1DP51172 638 aa15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHRNDQ07001 517 aa15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CHADLQ6NUI6 762 aa15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.57■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 EPS15P42566 896 aa15.56■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 APLP1P51693 650 aa15.56■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.56■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 GPRC5DQ9NZD1 345 aa15.56■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 HDAC5Q9UQL6 1122 aa15.56■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.56■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PSMD14O00487 310 aa15.55■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 POTEIP0CG38 1075 aa15.55■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 POTEJP0CG39 1038 aa15.55■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa15.55■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ANKRD44Q8N8A2 993 aa15.55■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 MED23Q9ULK4 1368 aa15.54■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PODNQ7Z5L7 613 aa15.54■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.54■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 H7C1D1 291 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 PLIN1O60240 522 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TAF5LO75529 589 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 TRIM27P14373 513 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 RPS12P25398 132 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 DPF2Q92785 391 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 COA1Q9GZY4 146 aa15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 VIL1P09327 827 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 CLUAP1Q96AJ1 413 aa15.52■□□□□ 0.08
USP3-AS1-205ENST00000560067 MYH3P11055 1940 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP17L3A6NCW0 530 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP17L4A6NCW7 530 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 GNAI3P08754 354 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 TXNRD3Q86VQ6 643 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MICALL2Q8IY33 904 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 LTBP1Q14766 1721 aa15.51■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SCN4AP35499 1836 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MROH5Q6ZUA9 1318 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 SNAP23O00161 211 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 KLRK1P26718 216 aa15.5■□□□□ 0.07
USP3-AS1-205ENST00000560067 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms