RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
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TSPAN3-204ENST00000558394 CDCA5Q96FF9 252 aa23.29■■□□□ 1.32
TSPAN3-204ENST00000558394 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.29■■□□□ 1.32
TSPAN3-204ENST00000558394 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.29■■□□□ 1.32
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM89AQ96GI7 184 aa23.28■■□□□ 1.32
TSPAN3-204ENST00000558394 RTL9Q8NET4 1388 aa23.27■■□□□ 1.32
TSPAN3-204ENST00000558394 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
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TSPAN3-204ENST00000558394 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.27■■□□□ 1.32
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TSPAN3-204ENST00000558394 RASAL3Q86YV0 1011 aa23.26■■□□□ 1.31
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TSPAN3-204ENST00000558394 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
TSPAN3-204ENST00000558394 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.25■■□□□ 1.31
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TSPAN3-204ENST00000558394 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.25■■□□□ 1.31
TSPAN3-204ENST00000558394 HPS5Q9UPZ3 1129 aa23.25■■□□□ 1.31
TSPAN3-204ENST00000558394 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.24■■□□□ 1.31
TSPAN3-204ENST00000558394 SCARF1Q14162 830 aa23.24■■□□□ 1.31
TSPAN3-204ENST00000558394 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
TSPAN3-204ENST00000558394 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
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TSPAN3-204ENST00000558394 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa23.22■■□□□ 1.31
TSPAN3-204ENST00000558394 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.22■■□□□ 1.31
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TSPAN3-204ENST00000558394 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.19■■□□□ 1.3
TSPAN3-204ENST00000558394 USP17L8P0C7I0 530 aa23.19■■□□□ 1.3
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TSPAN3-204ENST00000558394 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.19■■□□□ 1.3
TSPAN3-204ENST00000558394 TBC1D8O95759 1140 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPAN3-204ENST00000558394 NEUROD2Q15784 382 aa23.18■■□□□ 1.3
TSPAN3-204ENST00000558394 HYPKQ9NX55 129 aa23.17■■□□□ 1.3
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TSPAN3-204ENST00000558394 SREBF2Q12772 1141 aa23.13■■□□□ 1.29
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TSPAN3-204ENST00000558394 ATP2B4P23634 1241 aa23.12■■□□□ 1.29
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TSPAN3-204ENST00000558394 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.07■■□□□ 1.28
TSPAN3-204ENST00000558394 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
TSPAN3-204ENST00000558394 ALDH1A1P00352 501 aa23.05■■□□□ 1.28
TSPAN3-204ENST00000558394 WNT10BO00744 389 aa23.04■■□□□ 1.28
TSPAN3-204ENST00000558394 PRKG1Q13976 671 aa23.04■■□□□ 1.28
TSPAN3-204ENST00000558394 RALBP1Q15311 655 aa23.04■■□□□ 1.28
TSPAN3-204ENST00000558394 RUNDC1Q96C34 613 aa23.04■■□□□ 1.28
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