RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557667.5

RBM23-233, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 1 (best)

Gene RBM23, Length 4,240 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-233	ENST00000557667	CTSW	P56202	376 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	FOXO4	P98177	505 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ATRN	O75882	1429 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	TMTC2	Q8N394	836 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	LPIN2	Q92539	896 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	UBE3C	Q15386	1083 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		10.08	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	LRP5	O75197	1615 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	PROSER3	Q2NL68	480 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	UVSSA	Q2YD98	709 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SPTY2D1	Q68D10	685 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	TMX3	Q96JJ7	454 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	KIF2C	Q99661	725 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	PIGB	Q92521	554 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	MAP3K12	Q12852	859 aa		10.07	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ALX1	Q15699	326 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ATP2B3	Q16720	1220 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	APPBP2	Q92624	585 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SASH1	O94885	1247 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	MAP4K4	O95819	1239 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NHS	Q6T4R5	1651 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	FGD1	P98174	961 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	HS1BP3	Q53T59	392 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	METTL24	Q5JXM2	366 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NLRP10	Q86W26	655 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CFAP45	Q9UL16	551 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	TFCP2	Q12800	502 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SLF2	Q8IX21	1173 aa		10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	RPS6KB1	P23443	525 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	PDE4C	Q08493	712 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NECTIN1	Q15223	517 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CWC27	Q6UX04	472 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NEK1	Q96PY6	1258 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	BRD1	O95696	1058 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NBPF14	Q5TI25	921 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NBPF15	Q8N660	670 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	KRT23	Q9C075	422 aa		10.05	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	MYH3	P11055	1940 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CTAGE5	O15320	804 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	UBE4A	Q14139	1066 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	GSTO1	P78417	241 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	TMEM87B	Q96K49	555 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC196	A0A1B0GTZ2	297 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ATP6V1A	P38606	617 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ZNF445	P59923	1031 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	ELP1	O95163	1332 aa		10.04	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	SLC27A2	O14975	620 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
RBM23-233	ENST00000557667	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms