RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557266.5

RCCD1-208, Transcript of RCC1 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RCCD1, Length 2,110 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCCD1-208ENST00000557266 FAM173BQ6P4H8 233 aa26.83■■□□□ 1.89
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RCCD1-208ENST00000557266 TIMM10P62072 90 aa26.83■■□□□ 1.88
RCCD1-208ENST00000557266 GIMAP6Q6P9H5 292 aa26.83■■□□□ 1.88
RCCD1-208ENST00000557266 GTF3C6Q969F1 213 aa26.83■■□□□ 1.88
RCCD1-208ENST00000557266 TNS2Q63HR2 1409 aa26.82■■□□□ 1.88
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RCCD1-208ENST00000557266 KLHL34Q8N239 644 aa26.82■■□□□ 1.88
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RCCD1-208ENST00000557266 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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RCCD1-208ENST00000557266 A0A1B0GUL7 405 aa26.75■■□□□ 1.87
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RCCD1-208ENST00000557266 BRF1Q92994 677 aa26.75■■□□□ 1.87
RCCD1-208ENST00000557266 ISCA1Q9BUE6 129 aa26.75■■□□□ 1.87
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RCCD1-208ENST00000557266 LIG1P18858 919 aa26.75■■□□□ 1.87
RCCD1-208ENST00000557266 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP26.75■■□□□ 1.87
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RCCD1-208ENST00000557266 SCRN1Q12765 414 aa26.74■■□□□ 1.87
RCCD1-208ENST00000557266 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP26.74■■□□□ 1.87
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RCCD1-208ENST00000557266 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RCCD1-208ENST00000557266 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RCCD1-208ENST00000557266 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
RCCD1-208ENST00000557266 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
RCCD1-208ENST00000557266 SPATA32Q96LK8 384 aa26.73■■□□□ 1.87
RCCD1-208ENST00000557266 STRN4Q9NRL3 753 aa26.73■■□□□ 1.87
RCCD1-208ENST00000557266 MAST3O60307 1309 aa26.73■■□□□ 1.87
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RCCD1-208ENST00000557266 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
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RCCD1-208ENST00000557266 CTDNEP1O95476 244 aa26.66■■□□□ 1.86
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RCCD1-208ENST00000557266 EVA1CP58658 441 aa26.66■■□□□ 1.86
RCCD1-208ENST00000557266 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.66■■□□□ 1.86
RCCD1-208ENST00000557266 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.65■■□□□ 1.86
RCCD1-208ENST00000557266 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.65■■□□□ 1.86
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