RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557092.5

NEDD1-209, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-209ENST00000557092 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD1-209ENST00000557092 XDHP47989 1333 aa23.39■■□□□ 1.34
NEDD1-209ENST00000557092 CASP7P55210 303 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 SLFN5Q08AF3 891 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 DOK7Q18PE1 504 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 G3V3G9 751 aa23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 ECE2O60344 883 aa23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 FAM161AQ3B820 660 aa23.37■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 PASKQ96RG2 1323 aa23.36■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 ITGA6P23229 1130 aa23.36■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 CNTROBQ8N137 903 aa23.36■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.36■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 PSMD14O00487 310 aa23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 ATP2B4P23634 1241 aa23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 CREBZFQ9NS37 354 aa23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 CSF1RP07333 972 aa23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 GRM8O00222 908 aa23.33■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 ALDH1L1O75891 902 aa23.33■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.33■■□□□ 1.33
NEDD1-209ENST00000557092 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 H7C1D1 291 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 MICALL2Q8IY33 904 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 SHTN1A0MZ66 631 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 FOXO4P98177 505 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 PTPRCP08575 1304 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 JMYQ8N9B5 988 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 DPF2Q92785 391 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 SCN9AQ15858 1988 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 MED23Q9ULK4 1368 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD1-209ENST00000557092 KCNJ4P48050 445 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 CHRNDQ07001 517 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 PODNQ7Z5L7 613 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 MIER1Q8N108 512 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 SUCLG2Q96I99 432 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 TRAF5O00463 557 aa23.24■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 CNTNAP1P78357 1384 aa23.24■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 PSME4Q14997 1843 aa23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 USP17L3A6NCW0 530 aa23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 USP17L4A6NCW7 530 aa23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 FBXW7Q969H0 707 aa23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 KLRK1P26718 216 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 COA1Q9GZY4 146 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 UTYO14607 1347 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-209ENST00000557092 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.2■■□□□ 1.3
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