RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.4■■□□□ 1.34
NEDD1-208ENST00000555806 XDHP47989 1333 aa23.39■■□□□ 1.34
NEDD1-208ENST00000555806 CASP7P55210 303 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 SLFN5Q08AF3 891 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 DOK7Q18PE1 504 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.39■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 G3V3G9 751 aa23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 ECE2O60344 883 aa23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.38■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 FAM161AQ3B820 660 aa23.37■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 PASKQ96RG2 1323 aa23.36■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 ITGA6P23229 1130 aa23.36■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 CNTROBQ8N137 903 aa23.36■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.36■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 PSMD14O00487 310 aa23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 ATP2B4P23634 1241 aa23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 CREBZFQ9NS37 354 aa23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.35■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 CSF1RP07333 972 aa23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 GRM8O00222 908 aa23.33■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 ALDH1L1O75891 902 aa23.33■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.33■■□□□ 1.33
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 H7C1D1 291 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 MICALL2Q8IY33 904 aa23.31■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 SHTN1A0MZ66 631 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 FOXO4P98177 505 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 PTPRCP08575 1304 aa23.3■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 JMYQ8N9B5 988 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 DPF2Q92785 391 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 SCN9AQ15858 1988 aa23.29■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 MED23Q9ULK4 1368 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.28■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.27■■□□□ 1.32
NEDD1-208ENST00000555806 KCNJ4P48050 445 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.26■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 CHRNDQ07001 517 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 PODNQ7Z5L7 613 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 MIER1Q8N108 512 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 SUCLG2Q96I99 432 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.25■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 TRAF5O00463 557 aa23.24■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 CNTNAP1P78357 1384 aa23.24■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 PSME4Q14997 1843 aa23.23■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L3A6NCW0 530 aa23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L4A6NCW7 530 aa23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 FBXW7Q969H0 707 aa23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.22■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 KLRK1P26718 216 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 COA1Q9GZY4 146 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 UTYO14607 1347 aa23.21■■□□□ 1.31
NEDD1-208ENST00000555806 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms