RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553876.2

RBM23-208, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 267 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-208	ENST00000553876	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	ELP3	Q9H9T3	547 aa		7.67	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	7.67	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		7.67	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	ICMT	O60725	284 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	SIK1	P57059	783 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	PLD4	Q96BZ4	506 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	CNTN3	Q9P232	1028 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	MTMR7	Q9Y216	660 aa		7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876		A0A0A0MRY4	1105 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	C1QTNF9B	B2RNN3	333 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	FAM13A	O94988	1023 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	KIF4A	O95239	1232 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	BAG6	P46379	1132 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	ATP11A	P98196	1134 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.65	□□□□□ -1.18
RBM23-208	ENST00000553876	ACPP	P15309	386 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	7.64	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	ARHGAP4	P98171	946 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	GJD3	Q8N144	294 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	TTC9	Q92623	222 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM33	Q9UPN9	1127 aa		7.64	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	GRIK4	Q16099	956 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	PRRT3	Q5FWE3	981 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	MSL1	Q68DK7	614 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	XKR5	Q6UX68	686 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	7.63	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.63	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	MSTN	O14793	375 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	GHRH	P01286	108 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	IGHA1	P01876	353 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	HYAL2	Q12891	473 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		7.62	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.62	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	SELP	P16109	830 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	PDE4C	Q08493	712 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	7.61	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		7.61	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	TNFRSF21	O75509	655 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	ELN	P15502	786 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	7.6	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	AAMP	Q13685	434 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	CEP120	Q8N960	986 aa		7.6	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	EREG	O14944	169 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	PCSK2	P16519	638 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	HHIP	Q96QV1	700 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		7.59	□□□□□ -1.19
RBM23-208	ENST00000553876	IGHA2	P01877	340 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	RAC1	P63000	192 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		7.58	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	SOWAHD	A6NJG2	315 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	NFKBIE	O00221	500 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	TRPA1	O75762	1119 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	CES1	P23141	567 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	USP5	P45974	858 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	IL22RA1	Q8N6P7	574 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	PBX4	Q9BYU1	374 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	RBSN	Q9H1K0	784 aa		7.57	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	TM4SF5	O14894	197 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	PHACTR2	O75167	634 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	BRD1	O95696	1058 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	MBTPS1	Q14703	1052 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	CEP135	Q66GS9	1140 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	FBXO11	Q86XK2	927 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		7.56	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	DLL1	O00548	723 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	GPR182	O15218	404 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	APBA3	O96018	575 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	EPHA1	P21709	976 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	EHHADH	Q08426	723 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	ADGRE1	Q14246	886 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	SETDB1	Q15047	1291 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	FAM129B	Q96TA1	746 aa		7.55	□□□□□ -1.2
RBM23-208	ENST00000553876	POP1	Q99575	1024 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2

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