RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.45■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 MTX1Q13505 466 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 LRRC24Q50LG9 513 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 ATP8B2P98198 1209 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa23.43■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 CHD4Q14839 1912 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 CHRNDQ07001 517 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 CEP85Q6P2H3 762 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 PSMD1Q99460 953 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 SIL1Q9H173 461 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 POLLQ9UGP5 575 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 LTBP1Q14766 1721 aa23.42■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 LTBP3Q9NS15 1303 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 C6orf229H3BNL8 230 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 TAF5LO75529 589 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 C9orf131Q5VYM1 1079 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 A0A1B0GUL6 1792 aa23.4■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 XDHP47989 1333 aa23.39■■□□□ 1.34
CTDSP2-207ENST00000551594 SNAP23O00161 211 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 LMNB1P20700 586 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 POLA2Q14181 598 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 COPRSQ9NQ92 184 aa23.39■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 EYA2O00167 538 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 UFL1O94874 794 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 SSH3Q8TE77 659 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 RNF181Q9P0P0 153 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 GGA1Q9UJY5 639 aa23.38■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 RIMBP2O15034 1052 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 IARSP41252 1262 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.37■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 ATP2B4P23634 1241 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 AOC3Q16853 763 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.36■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 PPIP5K2O43314 1243 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 METTL24Q5JXM2 366 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 COL4A5P29400 1685 aa23.35■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 MROH5Q6ZUA9 1318 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 WASHC4Q2M389 1173 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.34■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 CIAO1O76071 339 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 KCNJ4P48050 445 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.33■■□□□ 1.33
CTDSP2-207ENST00000551594 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 KLRK1P26718 216 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 VGLL2Q8N8G2 317 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 EYA3Q99504 573 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 FBXO3Q9UK99 471 aa23.32■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.31■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 DOK7Q18PE1 504 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.31■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 TIAM2Q8IVF5 1701 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 PDE8BO95263 885 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 VPS33BQ9H267 617 aa23.3■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 TFCP2Q12800 502 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 JDP2Q8WYK2 163 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.29■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 HMMRO75330 724 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 SASH1O94885 1247 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 NIM1KQ8IY84 436 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.28■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 MED23Q9ULK4 1368 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 UBE4AQ14139 1066 aa23.27■■□□□ 1.32
CTDSP2-207ENST00000551594 ECE2O60344 883 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDSP2-207ENST00000551594 FGFR2P21802 821 aa23.25■■□□□ 1.31
CTDSP2-207ENST00000551594 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CTDSP2-207ENST00000551594 YDJCA8MPS7 323 aa23.24■■□□□ 1.31
CTDSP2-207ENST00000551594 G3V3G9 751 aa23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.3 ms