RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.48■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 SCN4AP35499 1836 aa26.47■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 RAD17O75943 681 aa26.47■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 EPHX2P34913 555 aa26.47■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.47■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.47■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 GGA1Q9UJY5 639 aa26.46■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 XDHP47989 1333 aa26.45■■□□□ 1.83
CS-222ENST00000550996 EPS15P42566 896 aa26.45■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP26.45■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 KAZALD1Q96I82 304 aa26.45■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 APLP1P51693 650 aa26.44■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 HTRA3P83110 453 aa26.44■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 DOK7Q18PE1 504 aa26.44■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 CIAPIN1Q6FI81 312 aa26.44■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 CHADLQ6NUI6 762 aa26.44■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.44■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 UTYO14607 1347 aa26.43■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.43■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 LDHDQ86WU2 507 aa26.43■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 SUCLG2Q96I99 432 aa26.43■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 EYA3Q99504 573 aa26.43■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.42■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 ECE2O60344 883 aa26.41■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 GPRC5DQ9NZD1 345 aa26.41■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 SPEF2Q9C093 1822 aa26.41■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 ATP2B4P23634 1241 aa26.4■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 SHTN1A0MZ66 631 aa26.39■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.39■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 PSMD14O00487 310 aa26.39■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.39■■□□□ 1.82
CS-222ENST00000550996 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 TNIP1Q15025 636 aa26.38■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa26.37■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.37■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 USP44Q9H0E7 712 aa26.37■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 KLRK1P26718 216 aa26.36■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 CHRNDQ07001 517 aa26.36■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.36■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 SCN9AQ15858 1988 aa26.36■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.35■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 CLEC11AQ9Y240 323 aa26.35■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 PASKQ96RG2 1323 aa26.35■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 MED23Q9ULK4 1368 aa26.34■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 SNAP23O00161 211 aa26.34■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.33■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.33■■□□□ 1.81
CS-222ENST00000550996 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 TRPM4Q8TD43 1214 aa26.32■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.32■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.32■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 TAF5LO75529 589 aa26.31■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 BCAR3O75815 825 aa26.31■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 VIL1P09327 827 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 MICALL2Q8IY33 904 aa26.31■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.31■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.31■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 CNTROBQ8N137 903 aa26.3■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 DPF2Q92785 391 aa26.3■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 PCNTO95613 3336 aa26.29■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 G3V3G9 751 aa26.29■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.29■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.29■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 TNNQ9UQP3 1299 aa26.29■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 KIF16BQ96L93 1317 aa26.29■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 EGFRP00533 1210 aa26.28■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.28■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 RPS12P25398 132 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP26.27■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 PODNQ7Z5L7 613 aa26.27■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 ARHGAP45Q92619 1136 aa26.27■■□□□ 1.8
CS-222ENST00000550996 ZNF609O15014 1411 aa26.26■■□□□ 1.79
CS-222ENST00000550996 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
CS-222ENST00000550996 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.26■■□□□ 1.79
CS-222ENST00000550996 CNNM1Q9NRU3 951 aa26.26■■□□□ 1.79
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