RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 HACL1Q9UJ83 578 aa27.63■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 GGA1Q9UJY5 639 aa27.63■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 XDHP47989 1333 aa27.63■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP27.62■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 HSPA6P17066 643 aa27.62■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 CXCL9Q07325 125 aa27.62■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.62■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 SMC1BQ8NDV3 1235 aa27.62■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.62■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.62■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 UTYO14607 1347 aa27.62■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.61■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP27.61■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 SUCLG2Q96I99 432 aa27.6■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.6■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 YDJCA8MPS7 323 aa27.59■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 ATP2B4P23634 1241 aa27.59■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 DBNDD1Q9H9R9 158 aa27.59■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 RAD17O75943 681 aa27.58■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 POTEIP0CG38 1075 aa27.58■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 POTEJP0CG39 1038 aa27.58■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 DOK7Q18PE1 504 aa27.58■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 CIAPIN1Q6FI81 312 aa27.58■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 KAZALD1Q96I82 304 aa27.58■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.58■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
PUS1-211ENST00000544662 EPHX2P34913 555 aa27.57■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 SCNN1DP51172 638 aa27.57■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 USP44Q9H0E7 712 aa27.57■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 ECE2O60344 883 aa27.56■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP27.56■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 TNIP1Q15025 636 aa27.56■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 KIF16BQ96L93 1317 aa27.56■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 CCT4P50991 539 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.55■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 EPS15P42566 896 aa27.54■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 CHADLQ6NUI6 762 aa27.54■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.54■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD2Q9GZV1 360 aa27.54■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 ARHGAP45Q92619 1136 aa27.53■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP27.53■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 G3V3G9 751 aa27.52■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 BCAR3O75815 825 aa27.52■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 CHRNDQ07001 517 aa27.52■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 DCAF8Q5TAQ9 597 aa27.52■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 LDHDQ86WU2 507 aa27.52■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 KCNQ5Q9NR82 932 aa27.52■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 GPRC5DQ9NZD1 345 aa27.52■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa27.52■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 SCN9AQ15858 1988 aa27.51■■■□□ 2
PUS1-211ENST00000544662 MED23Q9ULK4 1368 aa27.51■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 A0A1B0GUL6 1792 aa27.51■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 PSMD14O00487 310 aa27.51■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.51■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 TAF7LQ5H9L4 462 aa27.51■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.51■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 LEMD3Q9Y2U8 911 aa27.51■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 APLP1P51693 650 aa27.5■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa27.49■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 CLEC11AQ9Y240 323 aa27.49■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 ZNF804BA4D1E1 1349 aa27.48■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP27.48■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.48■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 CNNM1Q9NRU3 951 aa27.47■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP27.47■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 TAF5LO75529 589 aa27.46■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 KCNJ4P48050 445 aa27.46■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 TXNRD3Q86VQ6 643 aa27.46■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 PSME4Q14997 1843 aa27.46■■□□□ 1.99
PUS1-211ENST00000544662 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 TRIM27P14373 513 aa27.45■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa27.45■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 TNNQ9UQP3 1299 aa27.45■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 KLRK1P26718 216 aa27.44■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 PODNQ7Z5L7 613 aa27.44■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 DPF2Q92785 391 aa27.44■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 SHTN1A0MZ66 631 aa27.43■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 SNAP23O00161 211 aa27.43■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 VIL1P09327 827 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 PLIN1O60240 522 aa27.42■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 RPS12P25398 132 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 MICALL2Q8IY33 904 aa27.42■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 COA1Q9GZY4 146 aa27.42■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 H7C1D1 291 aa27.41■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 HTRA3P83110 453 aa27.41■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 MEIS3Q99687 375 aa27.41■■□□□ 1.98
PUS1-211ENST00000544662 USP17L3A6NCW0 530 aa27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms