RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542324.6

CS-202, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CS, Length 1,893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-202ENST00000542324 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
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CS-202ENST00000542324 KINO60870 393 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 ADD1P35611 737 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 FAM160A1Q05DH4 1040 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 SUCLG2Q96I99 432 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 L2HGDHQ9H9P8 463 aa12.35□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP12.35□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa12.35□□□□□ -0.43
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CS-202ENST00000542324 LTKP29376 864 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 KMT5BQ4FZB7 885 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 ENGASEQ8NFI3 743 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 EID1Q9Y6B2 187 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 COL15A1P39059 1388 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 CCP110O43303 1012 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 STK3Q13188 491 aa12.34□□□□□ -0.43
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CS-202ENST00000542324 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 ZNF592Q92610 1267 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 BOLA2Q9H3K6 86 aa12.34□□□□□ -0.43
CS-202ENST00000542324 RGPD2P0DJD1 1756 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 Q6ZUG5 572 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 KAZALD1Q96I82 304 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 TCEANC2Q96MN5 208 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 AGXT2Q9BYV1 514 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 LGR6Q9HBX8 967 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 ERBB3P21860 1342 aa12.33□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PQ27 194 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PQ64 194 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 A0A1W2PQD8 194 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 USP27XA6NNY8 438 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 DTNBO60941 627 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 TAF6LQ9Y6J9 622 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 SH3TC1Q8TE82 1336 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 SPEF2Q9C093 1822 aa12.32□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 RNMTO43148 476 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 KCNQ3O43525 872 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 TPM4P67936 248 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 SCRN1Q12765 414 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 RGS22Q8NE09 1264 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 COPRSQ9NQ92 184 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 ZNF609O15014 1411 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 SLIT3O75094 1523 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 PALLDQ8WX93 1383 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 SALL1Q9NSC2 1324 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 ANXA1P04083 346 aa12.31□□□□□ -0.44
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CS-202ENST00000542324 ABTB2Q8N961 1025 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 FSIP1Q8NA03 581 aa12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP12.31□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 USP16Q9Y5T5 823 aa12.31□□□□□ -0.44
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CS-202ENST00000542324 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 CCDC93Q567U6 631 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 AOPEPQ8N6M6 819 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 USHBP1Q8N6Y0 703 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa12.3□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 PTPDC1A2A3K4 754 aa12.29□□□□□ -0.44
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CS-202ENST00000542324 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
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CS-202ENST00000542324 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
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CS-202ENST00000542324 ATP8B1O43520 1251 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 CYP21A2P08686 494 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 KCNH5Q8NCM2 988 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 SLC26A8Q96RN1 970 aa12.29□□□□□ -0.44
CS-202ENST00000542324 HAUS7Q99871 368 aa12.29□□□□□ -0.44
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