RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, human

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LMO3-222	ENST00000540445	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.51	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		11.51	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	RASSF10	A6NK89	507 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	DOK7	Q18PE1	504 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		11.5	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	VEGFB	P49765	207 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	CTSW	P56202	376 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	11.49	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	GGA1	Q9UJY5	639 aa		11.49	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445		H7C1D1	291 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445		H7C1W4	665 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	UFL1	O94874	794 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	GCKR	Q14397	625 aa		11.48	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	RTL9	Q8NET4	1388 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445		F6X3S4	739 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	TRAF5	O00463	557 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	PSMD14	O00487	310 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	ECE2	O60344	883 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	CST9	Q5W186	159 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	LINS1	Q8NG48	757 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	DPF2	Q92785	391 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	GREM2	Q9H772	168 aa		11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF609	O15014	1411 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	FOXN1	O15353	648 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	ATP2B4	P23634	1241 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.46	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
LMO3-222	ENST00000540445	XDH	P47989	1333 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	ITGA6	P23229	1130 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CASP7	P55210	303 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	MICALL2	Q8IY33	904 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	WBP1L	Q9NX94	342 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	TLL2	Q9Y6L7	1015 aa		11.45	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	11.44	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		11.44	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	EGFR	P00533	1210 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	BEND3	Q5T5X7	828 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		11.43	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF521	Q96K83	1311 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445		E9PSI1	815 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CSF1R	P07333	972 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	GRM1	Q13255	1194 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	FAM161A	Q3B820	660 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CAPNS2	Q96L46	248 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		11.42	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	MED23	Q9ULK4	1368 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	GRM8	O00222	908 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	ECE1	P42892	770 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	KCNJ4	P48050	445 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	USP48	Q86UV5	1035 aa		11.41	□□□□□ -0.58
LMO3-222	ENST00000540445	DCPS	Q96C86	337 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58

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