RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526095.1

KCNQ1-206, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 3

Gene KCNQ1, Length 1,046 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-206ENST00000526095 KSR2Q6VAB6 950 aa20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 MICALL2Q8IY33 904 aa20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 EYA3Q99504 573 aa20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 CHMP4AQ9BY43 222 aa20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.16■□□□□ 0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 AIDAQ96BJ3 306 aa20.15■□□□□ 0.82
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 IL16Q14005 1332 aa20.14■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 G2E3Q7L622 706 aa20.14■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 DPF2Q92785 391 aa20.14■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 STK31Q9BXU1 1019 aa20.14■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 TLL2Q9Y6L7 1015 aa20.14■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 H7C1D1 291 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 UFL1O94874 794 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CYP4F22Q6NT55 531 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CAPNS2Q96L46 248 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 MRS2Q9HD23 443 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.13■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CELF2O95319 508 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 EGFRP00533 1210 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CTSWP56202 376 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 PRDM10Q9NQV6 1147 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 GGA1Q9UJY5 639 aa20.12■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 GRM1Q13255 1194 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.11■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 FANCIQ9NVI1 1328 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 NEURL1BA8MQ27 555 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 SLC4A2P04920 1241 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ECE1P42892 770 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 NEXNQ0ZGT2 675 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 SAPCD2Q86UD0 394 aa20.1■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 XDHP47989 1333 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ANP32CO43423 234 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 LBX1P52954 281 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 DLK2Q6UY11 383 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF408Q9H9D4 720 aa20.09■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 USP48Q86UV5 1035 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 GREM2Q9H772 168 aa20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF609O15014 1411 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 A0A1B0GUL6 1792 aa20.08■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 AOC2O75106 756 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 FLIIQ13045 1269 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 G3V3G9 751 aa20.06■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 H7C1W4 665 aa20.06■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.06■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 ATP2B4P23634 1241 aa20.05■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.05■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 HHIPL1Q96JK4 782 aa20.05■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 MINPP1Q9UNW1 487 aa20.05■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 ADM5C9JUS6 153 aa20.04■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 VAMP4O75379 141 aa20.04■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 GCKRQ14397 625 aa20.04■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.04■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 WDR63Q8IWG1 891 aa20.04■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 MAP2K2P36507 400 aa20.03■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 CASP7P55210 303 aa20.03■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 DNAAF4Q8WXU2 420 aa20.03■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 MED23Q9ULK4 1368 aa20.03■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.02■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 GMLQ99445 158 aa20.02■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.02■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 GGA3Q9NZ52 723 aa20.02■□□□□ 0.8
KCNQ1-206ENST00000526095 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 FAM161AQ3B820 660 aa20.01■□□□□ 0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 LINS1Q8NG48 757 aa20.01■□□□□ 0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa20.01■□□□□ 0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 ITGA6P23229 1130 aa20■□□□□ 0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 HUNKP57058 714 aa20■□□□□ 0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 PODNQ7Z5L7 613 aa20■□□□□ 0.79
KCNQ1-206ENST00000526095 BEGAINQ9BUH8 593 aa20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms