RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525939.1

ABCA7-208, Transcript of ATP binding cassette subfamily A member 7, human

TSL 3

Gene ABCA7, Length 374 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCA7-208	ENST00000525939	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ABCA7-208	ENST00000525939	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ABCA7-208	ENST00000525939	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	28.02	■■■□□ 2.08
ABCA7-208	ENST00000525939	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.02	■■■□□ 2.08
ABCA7-208	ENST00000525939		A0A1B0GUL6	1792 aa		28.01	■■■□□ 2.08
ABCA7-208	ENST00000525939	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	28.01	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	SUCLG2	Q96I99	432 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	GGA1	Q9UJY5	639 aa		28.01	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	C6orf229	H3BNL8	230 aa		28	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	28	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	BCAR3	O75815	825 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	ATP2B4	P23634	1241 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		27.99	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	PSME4	Q14997	1843 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	UFL1	O94874	794 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		27.97	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	CXCL9	Q07325	125 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		27.96	■■■□□ 2.07
ABCA7-208	ENST00000525939	FSTL1	Q12841	308 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.95	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	YDJC	A8MPS7	323 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	TRIM27	P14373	513 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	MED23	Q9ULK4	1368 aa		27.94	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.93	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	RIMBP2	O15034	1052 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	TNIP1	Q15025	636 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		27.92	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	SCNN1D	P51172	638 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	CHRND	Q07001	517 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		27.91	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	ECE2	O60344	883 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		27.9	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		27.89	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
ABCA7-208	ENST00000525939	EPHX2	P34913	555 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		27.88	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	RAD17	O75943	681 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	DOK7	Q18PE1	504 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	PODN	Q7Z5L7	613 aa		27.87	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF609	O15014	1411 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	HSPA6	P17066	643 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.86	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	GNAI3	P08754	354 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	LDHD	Q86WU2	507 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		27.85	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	PSMD14	O00487	310 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	DPF2	Q92785	391 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	MEIS3	Q99687	375 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	TNN	Q9UQP3	1299 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.84	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939		G3V3G9	751 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	EPS15	P42566	896 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	CHADL	Q6NUI6	762 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	COA1	Q9GZY4	146 aa		27.83	■■■□□ 2.05
ABCA7-208	ENST00000525939	POTEI	P0CG38	1075 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	POTEJ	P0CG39	1038 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	CEP350	Q5VT06	3117 aa		27.82	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	TAF5L	O75529	589 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	KCNJ4	P48050	445 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		27.81	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.81	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
ABCA7-208	ENST00000525939	UBE4A	Q14139	1066 aa		27.79	■■■□□ 2.04

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