RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP19.09■□□□□ 0.65
TRPS1-206ENST00000517323 ADORA1P30542 326 aa19.08■□□□□ 0.65
TRPS1-206ENST00000517323 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.08■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 CIAO1O76071 339 aa19.07■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 OLFM4Q6UX06 510 aa19.07■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa19.06■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 VGLL2Q8N8G2 317 aa19.06■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1B0GUL6 1792 aa19.06■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1B0GUL7 405 aa19.06■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 CEP126Q9P2H0 1117 aa19.06■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 RTL9Q8NET4 1388 aa19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 CHRNA5P30532 468 aa19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 CHRNDQ07001 517 aa19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 TTC22Q5TAA0 569 aa19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF609O15014 1411 aa19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 C8orf34Q49A92 452 aa19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 CRY2Q49AN0 593 aa19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 PI4K2BQ8TCG2 481 aa19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP19.05■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 RPS8P62241 208 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 SEC24BO95487 1268 aa19.03■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 MINPP1Q9UNW1 487 aa19.03■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 PDE8BO95263 885 aa19.02■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 SDSP20132 328 aa19.02■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 KLRK1P26718 216 aa19.02■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 BRIP1Q9BX63 1249 aa19.02■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 BOLA2Q9H3K6 86 aa19.02■□□□□ 0.64
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 ATP2B3Q16720 1220 aa19.01■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 PI16Q6UXB8 463 aa19.01■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 XAGE2Q96GT9 111 aa19.01■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 STAP2Q9UGK3 403 aa19.01■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa19■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 SRGNP10124 158 aa19■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 GRAPQ13588 217 aa19■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 RILPL2Q969X0 211 aa19■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 ECHDC1Q9NTX5 307 aa19■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.632e-8■□□□□ 10.5
TRPS1-206ENST00000517323 OSBPL3Q9H4L5 887 aa19■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 AK9Q5TCS8 1911 aa19■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 CHGBP05060 677 aa18.99■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 SCARF1Q14162 830 aa18.99■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 BMP2KLQ5H9B9 411 aa18.99■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.99■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 KLHL34Q8N239 644 aa18.99■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.99■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 MROH5Q6ZUA9 1318 aa18.99■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 SNRKQ9NRH2 765 aa18.99■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 FBXO3Q9UK99 471 aa18.98■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 SLX4Q8IY92 1834 aa18.98■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 BACH2Q9BYV9 841 aa18.98■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 A0A0G2JLW4 131 aa18.97■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 FGFR2P21802 821 aa18.97■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 PHKA1P46020 1223 aa18.97■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 PDE6BP35913 854 aa18.96■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 GORABQ5T7V8 394 aa18.96■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.96■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 SLC16A10Q8TF71 515 aa18.96■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 MTFR1LQ9H019 292 aa18.96■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 GYG1P46976 350 aa18.96■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 BCAMP50895 628 aa18.96■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.96■□□□□ 0.63
TRPS1-206ENST00000517323 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 GPSM2P81274 684 aa18.95■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 SLFNL1Q499Z3 407 aa18.95■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 GPR108Q9NPR9 543 aa18.95■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 AKAP2Q9Y2D5 859 aa18.95■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 TTC41PQ6P2S7 1318 aa18.95■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa18.95■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 ANTXR1Q9H6X2 564 aa18.95■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 C10orf71Q711Q0 1435 aa18.94■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 ARAP2Q8WZ64 1704 aa18.94■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 H0YIN7 160 aa18.93■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 NPR1P16066 1061 aa18.93■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC102BQ68D86 513 aa18.93■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 LPIN2Q92539 896 aa18.93■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 GPATCH3Q96I76 525 aa18.93■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 IL25Q9H293 177 aa18.93■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 AKAP11Q9UKA4 1901 aa18.93■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 PTGER2P43116 358 aa18.93■□□□□ 0.62
TRPS1-206ENST00000517323 TTC39AQ5SRH9 613 aa18.93■□□□□ 0.62
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