RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 ADAM32Q8TC27 787 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 TLR9Q9NR96 1032 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 XIRP2A4UGR9 3374 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYOM3Q5VTT5 1437 aa3□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 IFT172Q9UG01 1749 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 AOX1Q06278 1338 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 SOX12O15370 315 aa2.99□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 GRK4P32298 578 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 UBXN2AP68543 259 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 RING1Q06587 406 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 MOB2Q70IA6 237 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGEF25Q86VW2 580 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 CNKSR1Q969H4 720 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 TIFAQ96CG3 184 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIRT1Q96EB6 747 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 DEFB118Q96PH6 123 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRAM1Q96QH2 718 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 UNC93B1Q9H1C4 597 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYO9AB2RTY4 2548 aa2.99□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa2.98□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 NBL1P41271 181 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 NLRP6P59044 892 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFIXQ14938 502 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 POTEBQ6S5H4 581 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 SULF1Q8IWU6 871 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 CDCA5Q96FF9 252 aa2.98□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 GGA3Q9NZ52 723 aa2.98□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 COG5Q9UP83 839 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa2.98□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C5P01031 1676 aa2.98□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 ENO4A6NNW6 628 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 KDM4AO75164 1064 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 CAPN2P17655 700 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDE6BP35913 854 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRMT2P55345 433 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP2.97□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 PKN1Q16512 942 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 OLFM4Q6UX06 510 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 FRMD5Q7Z6J6 570 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAET1EQ8TD07 263 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 WHAMMQ8TF30 809 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 C7orf43Q8WVR3 580 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 HERVK_113Q902F9 699 aa2.97□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa2.97□□□□□ -1.93
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RNU6-548P-201ENST00000517083 C11orf49Q9H6J7 331 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 POGKQ9P215 609 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 CHIC2Q9UKJ5 165 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 ASPMQ8IZT6 3477 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 FLT4P35916 1363 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPEGQ15772 3267 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 DNAH14Q0VDD8 3507 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 LY75O60449 1722 aa2.96□□□□□ -1.93
RNU6-548P-201ENST00000517083 LCHNA4D1U4 455 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-548P-201ENST00000517083 PROS1P07225 676 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-548P-201ENST00000517083 INHBEP58166 350 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-548P-201ENST00000517083 KIF22Q14807 665 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPRYD7Q5W111 196 aa2.96□□□□□ -1.94
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