RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516206.1

RNU6-904P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 904, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-904P, Length 101 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-904P-201ENST00000516206 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP3□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 ANKLE2Q86XL3 938 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 PLPP7Q8NBV4 271 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 UBASH3BQ8TF42 649 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 CARD10Q9BWT7 1032 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 PPME1Q9Y570 386 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 GAS2O43903 313 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 SASH3O75995 380 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 TSPAN15O95858 294 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 CDC25BP30305 580 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 NRLP54845 237 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 PSME1Q06323 249 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 MAP7D1Q3KQU3 841 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 SGO2Q562F6 1265 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 GLIS3Q8NEA6 775 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 RELTQ969Z4 430 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 IFT43Q96FT9 208 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 HIF3AQ9Y2N7 669 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 CHMP3Q9Y3E7 222 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 MEGF11A6BM72 1044 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 GHRHP01286 108 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 MLANAQ16655 118 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 ANKRD34AQ69YU3 496 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 MUC3BQ9H195 1237 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM53CQ9NYF3 392 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 ADAM11O75078 769 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 EPB42P16452 691 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 HOXA5P20719 270 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 SIK1P57059 783 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 GTF2IP78347 998 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 FDX2Q6P4F2 183 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 SPRED2Q7Z698 418 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 GGNQ86UU5 652 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 C20orf173Q96LM9 149 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 PPP1R16BQ96T49 567 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM117AQ9C073 453 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC5A6Q9Y289 635 aa2.97□□□□□ -1.93
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM170BA6NMN3 283 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 ADMP35318 185 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 NFKBIBQ15653 356 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 HIF1AQ16665 826 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 RTN1Q16799 776 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 WFDC3Q8IUB2 231 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 DDRGK1Q96HY6 314 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 NGLY1Q96IV0 654 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 LACRTQ9GZZ8 138 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 RBSNQ9H1K0 784 aa2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 TM4SF5O14894 197 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 FSCN2O14926 492 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 IER5Q5VY09 327 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 PAOXQ6QHF9 649 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 POTEAQ6S8J7 498 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 LRRN4CLQ8ND94 238 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 TBC1D32Q96NH3 1257 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 SLC24A3Q9HC58 644 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa2.95□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 TGFBR3LH3BV60 316 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 C1QTNF9P0C862 333 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 KRTAP10-2P60368 255 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 PLCB2Q00722 1185 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 BNIP3Q12983 259 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZAR1Q86SH2 424 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 AMIGO3Q86WK7 504 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 KLHL23Q8NBE8 558 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 MTMR14Q8NCE2 650 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 KLHDC7BQ96G42 594 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 RUSC1Q9BVN2 902 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 RNF208Q9H0X6 261 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 NOD1Q9Y239 953 aa2.94□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa2.93□□□□□ -1.94
RNU6-904P-201ENST00000516206 NPIPB6E9PJ23 425 aa2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms