RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	UBE2H	P62256	183 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	GUCA2A	Q02747	115 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	SMAP1	Q8IYB5	467 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	STK31	Q9BXU1	1019 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	AK9	Q5TCS8	1911 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	DIP2A	Q14689	1571 aa		5.97	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	TNR	Q92752	1358 aa		5.96	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	PLEKHG1	Q9ULL1	1385 aa		5.96	□□□□□ -1.45
ATXN3-212	ENST00000515746	AP5Z1	O43299	807 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ADCY5	O95622	1261 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SYT1	P21579	422 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ST3GAL1	Q11201	340 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MORN1	Q5T089	497 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	HYPK	Q9NX55	129 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDHGC3	Q9UN70	934 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MTMR6	Q9Y217	621 aa		5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MED1	Q15648	1581 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	STX6	O43752	255 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	LILRB3	O75022	631 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	F13A1	P00488	732 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	AK2	P54819	239 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MTX1	Q13505	466 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	QPCT	Q16769	361 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	KIAA1524	Q8TCG1	905 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	RILPL2	Q969X0	211 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SNRK	Q9NRH2	765 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	DIP2B	Q9P265	1576 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	USP25	Q9UHP3	1055 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC27A5	Q9Y2P5	690 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	USP54	Q70EL1	1684 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	FMN2	Q9NZ56	1722 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	NR1I2	O75469	434 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	LARGE1	O95461	756 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TPM3	P06753	285 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	HOXB7	P09629	217 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	MTMR2	Q13614	643 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746		Q3C1V9	767 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	BEND3	Q5T5X7	828 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	UTP14C	Q5TAP6	766 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS53	Q5VIR6	699 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	HCST	Q9UBK5	93 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PYCARD	Q9ULZ3	195 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PIK3C2A	O00443	1686 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	JCAD	Q9P266	1359 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	C6orf229	H3BNL8	230 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	RFC5	P40937	340 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	PTH1R	Q03431	593 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD7	Q92527	254 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	TSC1	Q92574	1164 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ATXN3-212	ENST00000515746	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		5.93	□□□□□ -1.46

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