RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		27.39	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	LRP5	O75197	1615 aa		27.39	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF831	Q5JPB2	1677 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	CHGB	P05060	677 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	VPS72	Q15906	364 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	XAGE2	Q96GT9	111 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	27.38	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	AK7	Q96M32	723 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		27.38	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	27.37	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		27.37	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	27.37	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	27.37	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	FSD2	A1L4K1	749 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	ADORA1	P30542	326 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	27.36	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	27.36	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	27.36	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	ABCC12	Q96J65	1359 aa		27.36	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	27.35	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	CAMTA2	O94983	1202 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	27.35	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	27.35	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		27.35	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	LARGE1	O95461	756 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	KRT32	Q14532	448 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	METTL24	Q5JXM2	366 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	GORAB	Q5T7V8	394 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	27.34	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		27.34	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	KCNQ2	O43526	872 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	RPS6KB1	P23443	525 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	C8orf37	Q96NL8	207 aa		27.33	■■□□□ 1.97
PDE4D-223	ENST00000515011	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	27.32	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	SUSD4	Q5VX71	490 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	NGLY1	Q96IV0	654 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	PARP10	Q53GL7	1025 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		27.32	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	ANKRD1	Q15327	319 aa		27.31	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	27.31	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		27.31	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		27.31	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	FOXD4L5	Q5VV16	416 aa	Predicted RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	ISY1	Q9ULR0	285 aa	Known RBP	27.3	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	LAMB2	P55268	1798 aa		27.3	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	27.29	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	MAST3	O60307	1309 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	27.29	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	ME3	Q16798	604 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		27.29	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	27.28	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	27.28	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	ST3GAL1	Q11201	340 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	SCARF1	Q14162	830 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		27.28	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	27.27	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	CYP21A2	P08686	494 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		27.27	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	PDE8B	O95263	885 aa		27.26	■■□□□ 1.96
PDE4D-223	ENST00000515011	NEK1	Q96PY6	1258 aa		27.26	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	27.25	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	NTSR2	O95665	410 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	27.25	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	27.25	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	HSPA1L	P34931	641 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	ZAP70	P43403	619 aa		27.25	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	RTL9	Q8NET4	1388 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	27.24	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	SPATA31A6	Q5VVP1	1343 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011		M0R2C6	588 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	27.24	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		27.24	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	27.23	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	SYT1	P21579	422 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	MYH7	P12883	1935 aa		27.23	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	STX6	O43752	255 aa		27.22	■■□□□ 1.95
PDE4D-223	ENST00000515011	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	27.22	■■□□□ 1.95

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms