RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514472.1

FGFR4-216, Transcript of fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

TSL 4

Gene FGFR4, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4-216ENST00000514472 ECE2O60344 883 aa28.73■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 LBX1P52954 281 aa28.73■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.73■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 SAPCD2Q86UD0 394 aa28.73■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.73■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 CACNA1FO60840 1977 aa28.73■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 PSME4Q14997 1843 aa28.73■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 RTL9Q8NET4 1388 aa28.73■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 DOK7Q18PE1 504 aa28.72■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.72■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 KSR2Q6VAB6 950 aa28.71■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.71■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 WWC1Q8IX03 1113 aa28.71■■■□□ 2.19
FGFR4-216ENST00000514472 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.7■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.7■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.69■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 IGKV5-2P06315 115 aa28.69■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.69■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 HHIPL1Q96JK4 782 aa28.69■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 EGFRP00533 1210 aa28.68■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.68■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 SPEF2Q9C093 1822 aa28.68■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 UFL1O94874 794 aa28.67■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 VIL1P09327 827 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 GRM1Q13255 1194 aa28.67■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 GGA1Q9UJY5 639 aa28.67■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 MAP2K2P36507 400 aa28.66■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 USP48Q86UV5 1035 aa28.66■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 STK31Q9BXU1 1019 aa28.65■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 IL16Q14005 1332 aa28.65■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 AOC2O75106 756 aa28.64■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 CTSWP56202 376 aa28.64■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 G2E3Q7L622 706 aa28.64■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.64■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.64■■■□□ 2.18
FGFR4-216ENST00000514472 DLK2Q6UY11 383 aa28.63■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.63■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 XDHP47989 1333 aa28.63■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF609O15014 1411 aa28.61■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.61■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 SLC4A2P04920 1241 aa28.61■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.61■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.6■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 BEGAINQ9BUH8 593 aa28.6■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 G3V3G9 751 aa28.59■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 ATP2B4P23634 1241 aa28.59■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.59■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 GREM2Q9H772 168 aa28.59■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 H7C1W4 665 aa28.58■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.58■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 AGBL3Q8NEM8 1001 aa28.58■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
FGFR4-216ENST00000514472 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa28.57■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 MINPP1Q9UNW1 487 aa28.57■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 GMLQ99445 158 aa28.56■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 MRS2Q9HD23 443 aa28.56■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.55■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 ADM5C9JUS6 153 aa28.55■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 HUNKP57058 714 aa28.55■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 FLIIQ13045 1269 aa28.55■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 PODNQ7Z5L7 613 aa28.55■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 GCKRQ14397 625 aa28.54■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.54■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 PLA2G12BQ9BX93 195 aa28.54■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 MED23Q9ULK4 1368 aa28.53■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 CASP7P55210 303 aa28.53■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 GGA3Q9NZ52 723 aa28.53■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 TSKSQ9UJT2 592 aa28.53■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 USP17L3A6NCW0 530 aa28.52■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 USP17L4A6NCW7 530 aa28.52■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 CA12O43570 354 aa28.52■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 VAMP4O75379 141 aa28.52■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.52■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 WDR63Q8IWG1 891 aa28.52■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 ZIC5Q96T25 663 aa28.52■■■□□ 2.16
FGFR4-216ENST00000514472 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
FGFR4-216ENST00000514472 NOGQ13253 232 aa28.51■■■□□ 2.15
FGFR4-216ENST00000514472 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.51■■■□□ 2.15
FGFR4-216ENST00000514472 SCARF1Q14162 830 aa28.5■■■□□ 2.15
FGFR4-216ENST00000514472 SULF1Q8IWU6 871 aa28.5■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms