RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507075.1

ARRDC3-204, Transcript of arrestin domain containing 3, human

TSL 2

Gene ARRDC3, Length 355 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARRDC3-204	ENST00000507075	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	GOPC	Q9HD26	462 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	NOD1	Q9Y239	953 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	LINC01387	J3KSC0	135 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	HIF1A	Q16665	826 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	NGLY1	Q96IV0	654 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	OSBPL1A	Q9BXW6	950 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	PPME1	Q9Y570	386 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	APBB1	O00213	710 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	EPB42	P16452	691 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	CFP	P27918	469 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	INPP5B	P32019	993 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	SIK1	P57059	783 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	FOXD4L4	Q8WXT5	416 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	SART1	O43290	800 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	C21orf2	O43822	256 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADAM11	O75078	769 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	MESP2	Q0VG99	397 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	SLC38A3	Q99624	504 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	KIAA1024	Q9UPX6	916 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ARRDC3-204	ENST00000507075	GHRH	P01286	108 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	IDH3A	P50213	366 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	5.02	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	TTLL10	Q6ZVT0	673 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM168A	Q92567	244 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	MUC3B	Q9H195	1237 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	BIN1	O00499	593 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	NCOA4	Q13772	614 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	NEUROD2	Q15784	382 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	SGO2	Q562F6	1265 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	TPCN2	Q8NHX9	752 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	CYP26A1	O43174	497 aa		5	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	CDC25B	P30305	580 aa		5	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ANKRD34A	Q69YU3	496 aa		5	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		5	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	TOX2	Q96NM4	488 aa		5	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	SKI	P12755	728 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	RTN1	Q16799	776 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	FSCN2	O14926	492 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ARSD	P51689	593 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ECM1	Q16610	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	TSEN2	Q8NCE0	465 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	TMEM40	Q8WWA1	233 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM84A	Q96KN4	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	RBSN	Q9H1K0	784 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	USP20	Q9Y2K6	914 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	GAS2	O43903	313 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	MMP20	O60882	483 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	PSAP	P07602	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ADM	P35318	185 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	SEMA3F	Q13275	785 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	CCDC102B	Q68D86	513 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ATG4D	Q86TL0	474 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	KLK14	Q9P0G3	267 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ARRDC3-204	ENST00000507075	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	SLC24A1	O60721	1099 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	RXRB	P28702	533 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	FDX2	Q6P4F2	183 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	RNF208	Q9H0X6	261 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	FAM170B	A6NMN3	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075		M0R2N6	131 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	LZTS3	O60299	673 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ARRDC3-204	ENST00000507075	CDC27	P30260	824 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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