RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 GGA1Q9UJY5 639 aa23.35■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 XDHP47989 1333 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 ITGA6P23229 1130 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 EPS15P42566 896 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 BCL2L13Q9BXK5 485 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 DBNDD1Q9H9R9 158 aa23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 GRM8O00222 908 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 ALDH1L1O75891 902 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 CSF1RP07333 972 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.33■■□□□ 1.33
HOXD11-202ENST00000498438 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 TNIP1Q15025 636 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 PTPRCP08575 1304 aa23.32■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 ECE2O60344 883 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 FOXO4P98177 505 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 DOK7Q18PE1 504 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 ALDH1L2Q3SY69 923 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 MINPP1Q9UNW1 487 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 SCN9AQ15858 1988 aa23.31■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 ATP2B4P23634 1241 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 PSMD14O00487 310 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 PASKQ96RG2 1323 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD11-202ENST00000498438 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 G3V3G9 751 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 DCAF8Q5TAQ9 597 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 A0A1B0GUL6 1792 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 PSME4Q14997 1843 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 SUCLG2Q96I99 432 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 MED23Q9ULK4 1368 aa23.25■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 CNTROBQ8N137 903 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 KLRG1Q96E93 195 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 UTYO14607 1347 aa23.24■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 SHTN1A0MZ66 631 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 MICALL2Q8IY33 904 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 CHRNDQ07001 517 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 DPF2Q92785 391 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 KAZALD1Q96I82 304 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 CREBZFQ9NS37 354 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.22■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.21■■□□□ 1.31
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 H7C1D1 291 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 KLRK1P26718 216 aa23.19■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 KCNJ4P48050 445 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 PODNQ7Z5L7 613 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 TXNRD3Q86VQ6 643 aa23.18■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF609O15014 1411 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 TAF5LO75529 589 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 USP44Q9H0E7 712 aa23.17■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 SNAP23O00161 211 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 SAMD7Q7Z3H4 446 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 COA1Q9GZY4 146 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.16■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.15■■□□□ 1.3
HOXD11-202ENST00000498438 KIF16BQ96L93 1317 aa23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms