RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF790	Q6PG37	636 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	14.57	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		14.57	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	14.56	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	SRGN	P10124	158 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	VEGFB	P49765	207 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	14.56	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	FMNL2	Q96PY5	1086 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		14.56	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	A1BG	P04217	495 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	LBX1	P52954	281 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	14.55	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	PHOX2B	Q99453	314 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	HACL1	Q9UJ83	578 aa		14.55	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CAMTA2	O94983	1202 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	SULF1	Q8IWU6	871 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	14.54	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	PASK	Q96RG2	1323 aa		14.54	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	NPR1	P16066	1061 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	EPHX2	P34913	555 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		14.53	□□□□□ -0.08
SKAP2-209	ENST00000497511	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	14.52	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		14.52	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM177B	A6PVY3	158 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	BTBD11	A6QL63	1104 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CNTROB	Q8N137	903 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN7A	Q01118	1682 aa		14.51	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	GRM1	Q13255	1194 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		14.5	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	JDP2	Q8WYK2	163 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ABHD8	Q96I13	439 aa		14.49	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	14.49	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	SLX4	Q8IY92	1834 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	RASSF10	A6NK89	507 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH1B1	P30837	517 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCN1	P35523	988 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	OLFM4	Q6UX06	510 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNE4	Q8N205	404 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	NLRP7	Q8WX94	980 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		14.48	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNQ3	O43525	872 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC10A3	P09131	477 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	GPC2	Q8N158	579 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	14.47	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	USP16	Q9Y5T5	823 aa		14.47	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	CFH	P08603	1231 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	14.46	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	14.46	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	RDH13	Q8NBN7	331 aa		14.46	□□□□□ -0.09
SKAP2-209	ENST00000497511	SCN4A	P35499	1836 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	ECE1	P42892	770 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNC4	Q03721	635 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNA1S	Q13698	1873 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	GPCPD1	Q9NPB8	672 aa		14.45	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	14.45	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	14.44	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		14.44	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	FZD9	O00144	591 aa		14.44	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	14.44	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	PRKAR2B	P31323	418 aa		14.44	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	14.43	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	14.43	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		14.43	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPNS2	Q96L46	248 aa		14.43	□□□□□ -0.1
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP53	Q96M91	514 aa		14.43	□□□□□ -0.1

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