RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495671.1

LRIG1-206, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, human

TSL 3

Gene LRIG1, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LRIG1-206	ENST00000495671	FAM229A	H3BQW9	127 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	MICAL2	O94851	1124 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	NID1	P14543	1247 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	ARSD	P51689	593 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	NUDT8	Q8WV74	236 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	DRC1	Q96MC2	740 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		6.1	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	TRBV21OR9-2	A0A075B6F4	123 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	PRMT3	O60678	531 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	APBA3	O96018	575 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	IFT43	Q96FT9	208 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	JPH1	Q9HDC5	661 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		6.09	□□□□□ -1.43
LRIG1-206	ENST00000495671	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	GATA4	P43694	442 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	SRPK2	P78362	688 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	DOC2B	Q14184	412 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	COX20	Q5RI15	118 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	STK32A	Q8WU08	396 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	ZFAT	Q9P243	1243 aa		6.08	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	OPLAH	O14841	1288 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	SASH3	O75995	380 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	MAP3K6	O95382	1288 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	FAM193A	P78312	1265 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	KCNA1	Q09470	495 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	GRIK4	Q16099	956 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	PCSK7	Q16549	785 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	OCLN	Q16625	522 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	FAM35A	Q86V20	835 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	TREML1	Q86YW5	311 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	NME8	Q8N427	588 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	NAGPA	Q9UK23	515 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	USP20	Q9Y2K6	914 aa		6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	ATG7	O95352	703 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	RARA	P10276	462 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	CPB1	P15086	417 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	AFF1	P51825	1210 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	RALBP1	Q15311	655 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	CMTR1	Q8N1G2	835 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	NACC1	Q96RE7	527 aa		6.06	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671		A0A0A0MRY4	1105 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		6.05	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	XYLB	O75191	536 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	EGFR	P00533	1210 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	ERCC3	P19447	782 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	ARID4A	P29374	1257 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	RAC1	P63000	192 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	TMEM164	Q5U3C3	297 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	C16orf46	Q6P387	395 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	COL26A1	Q96A83	441 aa		6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	ELN	P15502	786 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	GPLD1	P80108	840 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	PERM1	Q5SV97	790 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	PBXIP1	Q96AQ6	731 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		6.03	□□□□□ -1.44
LRIG1-206	ENST00000495671	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
LRIG1-206	ENST00000495671	C9orf172	C9J069	976 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LRIG1-206	ENST00000495671	NRL	P54845	237 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LRIG1-206	ENST00000495671	MSL1	Q68DK7	614 aa		6.02	□□□□□ -1.45
LRIG1-206	ENST00000495671	MORC4	Q8TE76	937 aa		6.02	□□□□□ -1.45

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms