RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495556.1

TNS1-219, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 2

Gene TNS1, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-219ENST00000495556 MCOLN1Q9GZU1 580 aa11.99□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 LRRC37AA6NMS7 1700 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 ADM5C9JUS6 153 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 EGFRP00533 1210 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 HOXB7P09629 217 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 NOGQ13253 232 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 DGKZQ13574 1117 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 RIC3Q7Z5B4 369 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 C2orf69Q8N8R5 385 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 HYPKQ9NX55 129 aa11.98□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 COL4A1P02462 1669 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 RPS12P25398 132 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 RPS8P62241 208 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 GOLGA2Q08379 1002 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 RGMBQ6NW40 437 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 TBC1D16Q8TBP0 767 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 ADAMTS8Q9UP79 889 aa11.97□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 RTL9Q8NET4 1388 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 UFL1O94874 794 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 MYD88Q99836 296 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 MBIPQ9NS73 344 aa11.96□□□□□ -0.49
TNS1-219ENST00000495556 SULF1Q8IWU6 871 aa11.95□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 GGA3Q9NZ52 723 aa11.95□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 GGA1Q9UJY5 639 aa11.95□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 CCDC102AQ96A19 550 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 SCN9AQ15858 1988 aa11.94□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 TRPA1O75762 1119 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 RGS19P49795 217 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 CCDC152Q4G0S7 254 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 PODXL2Q9NZ53 605 aa11.93□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 PDE8AO60658 829 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 SCARF1Q14162 830 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 CCDC191Q8NCU4 936 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 CDCA5Q96FF9 252 aa11.92□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 APAF1O14727 1248 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 GNAI1P63096 354 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 FBXW7Q969H0 707 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 RNF186Q9NXI6 227 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 AKAP11Q9UKA4 1901 aa11.91□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 XDHP47989 1333 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 DDX58O95786 925 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 SLC10A3P09131 477 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 ZNF853P0CG23 659 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 ATP2B4P23634 1241 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 C8orf58Q8NAV2 365 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 CSRNP1Q96S65 589 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 IFT57Q9NWB7 429 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 SAGE1Q9NXZ1 904 aa11.9□□□□□ -0.5
TNS1-219ENST00000495556 USP17L3A6NCW0 530 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 USP17L4A6NCW7 530 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 USP17L8P0C7I0 530 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 USP17L1Q7RTZ2 530 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa11.89□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 SLC34A2O95436 690 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 CTSWP56202 376 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 SOX10P56693 466 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 CCDC30Q5VVM6 783 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 MOB2Q70IA6 237 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 RASAL3Q86YV0 1011 aa11.88□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 UBE2Q2LH0YL09 131 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 PODNQ7Z5L7 613 aa11.87□□□□□ -0.51
TNS1-219ENST00000495556 GMLQ99445 158 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms