RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495423.1

SIMC1-208, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 913 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-208ENST00000495423 EYA3Q99504 573 aa30.06■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
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SIMC1-208ENST00000495423 NEUROD2Q15784 382 aa30.05■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 KCNQ5Q9NR82 932 aa30.04■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 CCDC146Q8IYE0 955 aa30.03■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 C2orf69Q8N8R5 385 aa30.03■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 TBC1D16Q8TBP0 767 aa30.03■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 HYPKQ9NX55 129 aa30.03■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.03■■■□□ 2.4
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SIMC1-208ENST00000495423 ADM5C9JUS6 153 aa30.02■■■□□ 2.4
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SIMC1-208ENST00000495423 CCDC102AQ96A19 550 aa30.02■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 ZNF609O15014 1411 aa30.02■■■□□ 2.4
SIMC1-208ENST00000495423 ANP32CO43423 234 aa30.01■■■□□ 2.39
SIMC1-208ENST00000495423 RUNDC1Q96C34 613 aa30.01■■■□□ 2.39
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SIMC1-208ENST00000495423 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa30■■■□□ 2.39
SIMC1-208ENST00000495423 CFAP44Q96MT7 982 aa30■■■□□ 2.39
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SIMC1-208ENST00000495423 GGA3Q9NZ52 723 aa29.96■■■□□ 2.39
SIMC1-208ENST00000495423 SLC10A3P09131 477 aa29.95■■■□□ 2.39
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SIMC1-208ENST00000495423 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
SIMC1-208ENST00000495423 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
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SIMC1-208ENST00000495423 AGBL3Q8NEM8 1001 aa29.92■■■□□ 2.38
SIMC1-208ENST00000495423 CDCA5Q96FF9 252 aa29.92■■■□□ 2.38
SIMC1-208ENST00000495423 MBIPQ9NS73 344 aa29.92■■■□□ 2.38
SIMC1-208ENST00000495423 GGA1Q9UJY5 639 aa29.92■■■□□ 2.38
SIMC1-208ENST00000495423 GOLGA2Q08379 1002 aa29.91■■■□□ 2.38
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SIMC1-208ENST00000495423 G3V3G9 751 aa29.89■■■□□ 2.38
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SIMC1-208ENST00000495423 PDE8AO60658 829 aa29.87■■■□□ 2.37
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SIMC1-208ENST00000495423 XDHP47989 1333 aa29.86■■■□□ 2.37
SIMC1-208ENST00000495423 MYOZ2Q9NPC6 264 aa29.84■■■□□ 2.37
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SIMC1-208ENST00000495423 IFT57Q9NWB7 429 aa29.83■■■□□ 2.37
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SIMC1-208ENST00000495423 PCDH10Q9P2E7 1040 aa29.76■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 CTSWP56202 376 aa29.75■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 C8orf58Q8NAV2 365 aa29.75■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.75■■■□□ 2.35
SIMC1-208ENST00000495423 MOB2Q70IA6 237 aa29.74■■■□□ 2.35
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