RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 SPEF2Q9C093 1822 aa8.75□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 CARMIL3Q8ND23 1372 aa8.75□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 BMP2KLQ5H9B9 411 aa8.74□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 TBC1D9BQ66K14 1250 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC125Q86Z20 511 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.74□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 SETDB2Q96T68 719 aa8.74□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 STAP2Q9UGK3 403 aa8.74□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 PSEN1P49768 467 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM193AP78312 1265 aa8.73□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 ARID3AQ99856 593 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 PHF14O94880 888 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 IL15P40933 162 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 CHMP3Q9Y3E7 222 aa8.73□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 UQCRHLA0A096LP55 91 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 EYA2O00167 538 aa8.72□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 SASH1O94885 1247 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 UQCRHP07919 91 aa8.72□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 PDE1AP54750 535 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF827Q17R98 1081 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC152Q4G0S7 254 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 TTC22Q5TAA0 569 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.72□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 TTC41PQ6P2S7 1318 aa8.72□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 MX1P20591 662 aa8.71□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 TPTE2Q6XPS3 522 aa8.71□□□□□ -1.01
SMARCE1-211ENST00000493660 SYNE4Q8N205 404 aa8.71□□□□□ -1.01
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SMARCE1-211ENST00000493660 NFIXQ14938 502 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 C8orf34Q49A92 452 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM5Q71RC9 77 aa8.71□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
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SMARCE1-211ENST00000493660 ABCC12Q96J65 1359 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 APPP05067 770 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 TM4SF1P30408 202 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 ERFEQ4G0M1 354 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 ATG9AQ7Z3C6 839 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 TICAM2Q86XR7 235 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 KLHDC4Q8TBB5 520 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 SIL1Q9H173 461 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 GREM2Q9H772 168 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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SMARCE1-211ENST00000493660 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 BECN1Q14457 450 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
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SMARCE1-211ENST00000493660 NUTM1Q86Y26 1132 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 NLGN1Q8N2Q7 840 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 STK32BQ9NY57 414 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa8.7□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM177BA6PVY3 158 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 ERC2O15083 957 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 CCDC173Q0VFZ6 552 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC15A2Q16348 729 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 TNNI3KQ59H18 835 aa8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
SMARCE1-211ENST00000493660 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
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