RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492225.5

FBXO11-209, Transcript of F-box protein 11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FBXO11, Length 2,216 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO11-209ENST00000492225 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 NECAB1Q8N987 351 aa14.7□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.7□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 NEK1Q96PY6 1258 aa14.7□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 TTC39AQ5SRH9 613 aa14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 XAGE2Q96GT9 111 aa14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 A0A0G2JS52 829 aa14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa14.69□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 CYP21A2P08686 494 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ITGA6P23229 1130 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ST3GAL1Q11201 340 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 WNK3Q9BYP7 1800 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 F13A1P00488 732 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ADORA1P30542 326 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 CTSWP56202 376 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 USP48Q86UV5 1035 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 GREM2Q9H772 168 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.68□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 TCHHQ07283 1943 aa14.67□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 METTL24Q5JXM2 366 aa14.67□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.67□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 SPEF2Q9C093 1822 aa14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 CNNM1Q9NRU3 951 aa14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 NUP98P52948 1817 aa14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 DOT1LQ8TEK3 1739 aa14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 DTNBO60941 627 aa14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ACSBG1Q96GR2 724 aa14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 MTMR6Q9Y217 621 aa14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.66□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 PDE8AO60658 829 aa14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ATP2B3Q16720 1220 aa14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 FAM43AQ8N2R8 423 aa14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 PDCP20941 246 aa14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ATP6V1AP38606 617 aa14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 EIF5P55010 431 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 PHLPP1O60346 1717 aa14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 MAST3O60307 1309 aa14.65□□□□□ -0.06
FBXO11-209ENST00000492225 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 STK3Q13188 491 aa14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 Q6ZUG5 572 aa14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 LTBP4Q8N2S1 1624 aa14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 MYH3P11055 1940 aa14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 SYCE3A1L190 88 aa14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 FGD1P98174 961 aa14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.63□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 SCARF1Q14162 830 aa14.63□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.63□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 OSBP2Q969R2 916 aa14.63□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.63□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa14.63□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 NRAPQ86VF7 1730 aa14.63□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.62□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 M0R2C6 588 aa14.62□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 ZAP70P43403 619 aa14.62□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 SIK1P57059 783 aa14.62□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa14.62□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 WASHC4Q2M389 1173 aa14.62□□□□□ -0.07
FBXO11-209ENST00000492225 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.8 ms