RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 C2orf69Q8N8R5 385 aa22.6■■□□□ 1.21
PKDCC-208ENST00000490302 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.6■■□□□ 1.21
PKDCC-208ENST00000490302 CFAP44Q96MT7 982 aa22.6■■□□□ 1.21
PKDCC-208ENST00000490302 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PKDCC-208ENST00000490302 DGKZQ13574 1117 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-208ENST00000490302 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-208ENST00000490302 RTL9Q8NET4 1388 aa22.59■■□□□ 1.21
PKDCC-208ENST00000490302 ADM5C9JUS6 153 aa22.58■■□□□ 1.21
PKDCC-208ENST00000490302 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.58■■□□□ 1.21
PKDCC-208ENST00000490302 COL4A1P02462 1669 aa22.58■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 G3V3G9 751 aa22.57■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.57■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 DCAF8Q5TAQ9 597 aa22.57■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC102AQ96A19 550 aa22.57■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 GOLGA2Q08379 1002 aa22.57■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.57■■□□□ 1.2
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PKDCC-208ENST00000490302 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.56■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 MBIPQ9NS73 344 aa22.56■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.56■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 UFL1O94874 794 aa22.55■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 SULF1Q8IWU6 871 aa22.55■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.55■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.54■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 GGA3Q9NZ52 723 aa22.54■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 GGA1Q9UJY5 639 aa22.54■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 SLC34A2O95436 690 aa22.53■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 MYD88Q99836 296 aa22.53■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa22.52■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.52■■□□□ 1.2
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.51■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 PDE8AO60658 829 aa22.5■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF853P0CG23 659 aa22.5■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.5■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 CDCA5Q96FF9 252 aa22.5■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 SLC10A3P09131 477 aa22.49■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 RNF186Q9NXI6 227 aa22.49■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 TRPA1O75762 1119 aa22.48■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 SCARF1Q14162 830 aa22.48■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 IFT57Q9NWB7 429 aa22.48■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF609O15014 1411 aa22.48■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 GNAI1P63096 354 aa22.48■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.48■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
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PKDCC-208ENST00000490302 CSRNP1Q96S65 589 aa22.47■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 SCN9AQ15858 1988 aa22.46■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 ATP2B4P23634 1241 aa22.46■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
PKDCC-208ENST00000490302 USP17L8P0C7I0 530 aa22.45■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 PODNQ7Z5L7 613 aa22.45■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 GMLQ99445 158 aa22.45■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 MYOZ2Q9NPC6 264 aa22.45■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 USP17L3A6NCW0 530 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 USP17L4A6NCW7 530 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 APAF1O14727 1248 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 FKBP1BP68106 108 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.44■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 C8orf58Q8NAV2 365 aa22.43■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.43■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa22.43■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC30Q5VVM6 783 aa22.42■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.41■■□□□ 1.18
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PKDCC-208ENST00000490302 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 MED23Q9ULK4 1368 aa22.39■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.39■■□□□ 1.18
PKDCC-208ENST00000490302 SOX10P56693 466 aa22.39■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 MINPP1Q9UNW1 487 aa22.39■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 PSME4Q14997 1843 aa22.38■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 KSR2Q6VAB6 950 aa22.38■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 MOB2Q70IA6 237 aa22.38■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.38■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 UBE2Q2LH0YL09 131 aa22.37■■□□□ 1.17
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