RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490205.1

NELFCD-210, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-210ENST00000490205 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
NELFCD-210ENST00000490205 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
NELFCD-210ENST00000490205 ABTB2Q8N961 1025 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFCD-210ENST00000490205 TP53INP1Q96A56 240 aa7.24□□□□□ -1.25
NELFCD-210ENST00000490205 ATP2B4P23634 1241 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFCD-210ENST00000490205 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFCD-210ENST00000490205 IL22RA1Q8N6P7 574 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFCD-210ENST00000490205 WFDC12Q8WWY7 111 aa7.23□□□□□ -1.25
NELFCD-210ENST00000490205 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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NELFCD-210ENST00000490205 SPACA7Q96KW9 195 aa7.22□□□□□ -1.25
NELFCD-210ENST00000490205 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
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NELFCD-210ENST00000490205 HYAL2Q12891 473 aa7.21□□□□□ -1.26
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NELFCD-210ENST00000490205 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
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NELFCD-210ENST00000490205 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.2□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 MUC3BQ9H195 1237 aa7.2□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.19□□□□□ -1.26
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NELFCD-210ENST00000490205 SEPT3Q9UH03 358 aa7.19□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.19□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.18□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.18□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa7.18□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 PPME1Q9Y570 386 aa7.18□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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NELFCD-210ENST00000490205 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 CEP135Q66GS9 1140 aa7.17□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
NELFCD-210ENST00000490205 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.17□□□□□ -1.26
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NELFCD-210ENST00000490205 ATP11AP98196 1134 aa7.16□□□□□ -1.26
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NELFCD-210ENST00000490205 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
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NELFCD-210ENST00000490205 CES1P23141 567 aa7.11□□□□□ -1.27
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NELFCD-210ENST00000490205 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.11□□□□□ -1.27
NELFCD-210ENST00000490205 PMEPA1Q969W9 287 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFCD-210ENST00000490205 CNTN3Q9P232 1028 aa7.11□□□□□ -1.27
NELFCD-210ENST00000490205 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.11□□□□□ -1.27
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NELFCD-210ENST00000490205 MPSTP25325 297 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFCD-210ENST00000490205 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
NELFCD-210ENST00000490205 LRP8Q14114 963 aa7.1□□□□□ -1.27
NELFCD-210ENST00000490205 Q6ZS46 218 aa7.1□□□□□ -1.27
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