RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488684.5

POLR2F-211, Transcript of RNA polymerase II subunit F, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR2F, Length 564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2F-211ENST00000488684 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.87■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 RTL9Q8NET4 1388 aa28.87■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.86■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.86■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 KSR2Q6VAB6 950 aa28.86■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP28.86■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.85■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 IGKV5-2P06315 115 aa28.85■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 LBX1P52954 281 aa28.85■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 SAMD7Q7Z3H4 446 aa28.85■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.85■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 GRM1Q13255 1194 aa28.84■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 SAPCD2Q86UD0 394 aa28.84■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 SCN9AQ15858 1988 aa28.84■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 EGFRP00533 1210 aa28.83■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 ECE1P42892 770 aa28.83■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.83■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa28.83■■■□□ 2.21
POLR2F-211ENST00000488684 UFL1O94874 794 aa28.82■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP28.82■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 DLK2Q6UY11 383 aa28.82■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 G2E3Q7L622 706 aa28.82■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 THSD7BQ9C0I4 1608 aa28.81■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 USP48Q86UV5 1035 aa28.81■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 GGA1Q9UJY5 639 aa28.81■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 STK31Q9BXU1 1019 aa28.8■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF408Q9H9D4 720 aa28.8■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 AOC2O75106 756 aa28.79■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 VIL1P09327 827 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa28.79■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 SLC4A2P04920 1241 aa28.78■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 CTSWP56202 376 aa28.78■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 TTLL11Q8NHH1 800 aa28.78■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 IL16Q14005 1332 aa28.77■■■□□ 2.2
POLR2F-211ENST00000488684 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.76■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.76■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 HHIPL1Q96JK4 782 aa28.76■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 XDHP47989 1333 aa28.75■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 G3V3G9 751 aa28.75■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 MAP2K2P36507 400 aa28.75■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 DCAF8Q5TAQ9 597 aa28.75■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 GREM2Q9H772 168 aa28.75■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 MRS2Q9HD23 443 aa28.75■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 H7C1W4 665 aa28.74■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
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POLR2F-211ENST00000488684 KRT26Q7Z3Y9 468 aa28.73■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 ATP2B4P23634 1241 aa28.72■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa28.72■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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POLR2F-211ENST00000488684 FANCIQ9NVI1 1328 aa28.71■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 ADM5C9JUS6 153 aa28.71■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP28.71■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa28.71■■■□□ 2.19
POLR2F-211ENST00000488684 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
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POLR2F-211ENST00000488684 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP28.7■■■□□ 2.19
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POLR2F-211ENST00000488684 PSME4Q14997 1843 aa28.69■■■□□ 2.18
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POLR2F-211ENST00000488684 TSKSQ9UJT2 592 aa28.69■■■□□ 2.18
POLR2F-211ENST00000488684 SPEF2Q9C093 1822 aa28.69■■■□□ 2.18
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POLR2F-211ENST00000488684 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
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POLR2F-211ENST00000488684 ZNF609O15014 1411 aa28.68■■■□□ 2.18
POLR2F-211ENST00000488684 ANP32CO43423 234 aa28.67■■■□□ 2.18
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POLR2F-211ENST00000488684 WDR63Q8IWG1 891 aa28.67■■■□□ 2.18
POLR2F-211ENST00000488684 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP28.66■■■□□ 2.18
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POLR2F-211ENST00000488684 CACNA1FO60840 1977 aa28.65■■■□□ 2.18
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POLR2F-211ENST00000488684 USP17L4A6NCW7 530 aa28.65■■■□□ 2.18
POLR2F-211ENST00000488684 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
POLR2F-211ENST00000488684 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
POLR2F-211ENST00000488684 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
POLR2F-211ENST00000488684 USP17L1Q7RTZ2 530 aa28.65■■■□□ 2.18
POLR2F-211ENST00000488684 MED23Q9ULK4 1368 aa28.64■■■□□ 2.18
POLR2F-211ENST00000488684 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
POLR2F-211ENST00000488684 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
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