RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488180.1

SP100-216, Transcript of SP100 nuclear antigen, human

TSL 2

Gene SP100, Length 3,333 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SP100-216	ENST00000488180	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	SMTNL1	A8MU46	457 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	TXNRD1	Q16881	649 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	ZNF827	Q17R98	1081 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	EFCC1	Q9HA90	598 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	SCN9A	Q15858	1988 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180		A0A087WZG4	1122 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	EXOC5	O00471	708 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	ZNF592	Q92610	1267 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	SLC4A9	Q96Q91	983 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	IFT57	Q9NWB7	429 aa		4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	UNCX	A6NJT0	531 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	TNNT1	P13805	278 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		4.4	□□□□□ -1.7
SP100-216	ENST00000488180	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	C14orf37	Q86TY3	774 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		4.4	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	PDS5A	Q29RF7	1337 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	KCNA3	P22001	575 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	GTF2A1	P52655	376 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	FAM193A	P78312	1265 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	DRC7	Q8IY82	874 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	ZNF428	Q96B54	188 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	COL4A6	Q14031	1691 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	KAT6B	Q8WYB5	2073 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	CLGN	O14967	610 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	NPHP1	O15259	732 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	CYP2C19	P33261	490 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	NBPF14	Q5TI25	921 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	TMC4	Q7Z404	712 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	USP48	Q86UV5	1035 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	CFAP44	Q96MT7	982 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	CFHR5	Q9BXR6	569 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	BRD1	O95696	1058 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	PTGS1	P23219	599 aa		4.39	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	SOX12	O15370	315 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	MX1	P20591	662 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	NEK4	P51957	841 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	CASC1	Q6TDU7	716 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	LINC00116	Q8NCU8	138 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	NARF	Q9UHQ1	456 aa		4.38	□□□□□ -1.71
SP100-216	ENST00000488180	EP400	Q96L91	3159 aa		4.38	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms