RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479589.5

NENF-204, Transcript of neudesin neurotrophic factor, humanhuman

TSL 2

Gene NENF, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NENF-204ENST00000479589 SPEF2Q9C093 1822 aa30.12■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 GPRC5DQ9NZD1 345 aa30.12■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 DOK7Q18PE1 504 aa30.11■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.11■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 BCL2L13Q9BXK5 485 aa30.11■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 XDHP47989 1333 aa30.11■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 ECE2O60344 883 aa30.1■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 FAM161AQ3B820 660 aa30.1■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 KLRG1Q96E93 195 aa30.1■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 ITGA6P23229 1130 aa30.09■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP30.09■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 G3V3G9 751 aa30.08■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 DCAF8Q5TAQ9 597 aa30.08■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
NENF-204ENST00000479589 PASKQ96RG2 1323 aa30.07■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 CSF1RP07333 972 aa30.07■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30.07■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP30.07■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 MINPP1Q9UNW1 487 aa30.07■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 GRM8O00222 908 aa30.06■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 PSMD14O00487 310 aa30.06■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 ALDH1L1O75891 902 aa30.06■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 ATP2B4P23634 1241 aa30.06■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 CNTROBQ8N137 903 aa30.06■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 SSH1Q8WYL5 1049 aa30.06■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 CHMP3Q9Y3E7 222 aa30.05■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 MPHOSPH8Q99549 860 aa30.04■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 KCNQ5Q9NR82 932 aa30.04■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 CREBZFQ9NS37 354 aa30.04■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 FOXO4P98177 505 aa30.03■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 PTPRCP08575 1304 aa30.02■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.02■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
NENF-204ENST00000479589 MIER1Q8N108 512 aa30.01■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 SHTN1A0MZ66 631 aa30■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 CCT4P50991 539 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 MICALL2Q8IY33 904 aa30■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 H7C1D1 291 aa29.99■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.99■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 EPHA10Q5JZY3 1008 aa29.99■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.99■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 DPF2Q92785 391 aa29.99■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.99■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 SCN9AQ15858 1988 aa29.99■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 ANKRD2Q9GZV1 360 aa29.98■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 MED23Q9ULK4 1368 aa29.98■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 TMEM88BA6NKF7 163 aa29.97■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 RPS12P25398 132 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 TRPM4Q8TD43 1214 aa29.97■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 JMYQ8N9B5 988 aa29.96■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 LEMD3Q9Y2U8 911 aa29.96■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 VIL1P09327 827 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 CHRNDQ07001 517 aa29.95■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.95■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP29.95■■■□□ 2.39
NENF-204ENST00000479589 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 TAF7LQ5H9L4 462 aa29.94■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 SUCLG2Q96I99 432 aa29.94■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 ZNF804BA4D1E1 1349 aa29.94■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 KCNJ4P48050 445 aa29.93■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 SAMD7Q7Z3H4 446 aa29.93■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 PODNQ7Z5L7 613 aa29.93■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 UTYO14607 1347 aa29.92■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 TRAF5O00463 557 aa29.91■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP29.91■■■□□ 2.385e-8■■■□□ 16
NENF-204ENST00000479589 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 PSME4Q14997 1843 aa29.91■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 USP17L3A6NCW0 530 aa29.9■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 USP17L4A6NCW7 530 aa29.9■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.9■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 TXNRD3Q86VQ6 643 aa29.9■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 PGAP2Q9UHJ9 254 aa29.9■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 CNTNAP1P78357 1384 aa29.9■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 KLRK1P26718 216 aa29.89■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 KAZALD1Q96I82 304 aa29.89■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 COA1Q9GZY4 146 aa29.89■■■□□ 2.38
NENF-204ENST00000479589 TAF5LO75529 589 aa29.88■■■□□ 2.37
NENF-204ENST00000479589 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa29.88■■■□□ 2.37
NENF-204ENST00000479589 AGBL3Q8NEM8 1001 aa29.88■■■□□ 2.37
NENF-204ENST00000479589 FBXW7Q969H0 707 aa29.88■■■□□ 2.37
NENF-204ENST00000479589 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.1 ms