RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479535.2

SYCE1-205, Transcript of synaptonemal complex central element protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SYCE1, Length 2,479 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE1-205ENST00000479535 NEK1Q96PY6 1258 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 ADORA1P30542 326 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 NLRP10Q86W26 655 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 TMEM87AQ8NBN3 555 aa15.99■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 TAF7LQ5H9L4 462 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 LRSAM1Q6UWE0 723 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.98■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa15.97■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 FBXO3Q9UK99 471 aa15.97■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 STK3Q13188 491 aa15.97■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 XAGE2Q96GT9 111 aa15.97■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 LRP6O75581 1613 aa15.97■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 AKAP2Q9Y2D5 859 aa15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 TCHHQ07283 1943 aa15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 PLCH1Q4KWH8 1693 aa15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC158Q5M9N0 1113 aa15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 GREM2Q9H772 168 aa15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 MAST3O60307 1309 aa15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 CDHR2Q9BYE9 1310 aa15.96■□□□□ 0.15
SYCE1-205ENST00000479535 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 FIBPO43427 364 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 TTC39AQ5SRH9 613 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 GORABQ5T7V8 394 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ITGA6P23229 1130 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 CCDC173Q0VFZ6 552 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 SCARF1Q14162 830 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 Q6ZUG5 572 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa15.95■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 KAT6BQ8WYB5 2073 aa15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ADAMTS2O95450 1211 aa15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 TICAM2Q86XR7 235 aa15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 PPP1R9BQ96SB3 815 aa15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 A0A0G2JLW4 131 aa15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 CTSWP56202 376 aa15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 RIC1Q4ADV7 1423 aa15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa15.94■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 M0R2C6 588 aa15.93■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa15.93■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 OSBP2Q969R2 916 aa15.93■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 METTL24Q5JXM2 366 aa15.93■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 UBE2HP62256 183 aa15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 GTF3C6Q969F1 213 aa15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 SPEF2Q9C093 1822 aa15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 A0A0G2JS52 829 aa15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ZAP70P43403 619 aa15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ATP2B3Q16720 1220 aa15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 PI16Q6UXB8 463 aa15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 FERMT3Q86UX7 667 aa15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 BRF1Q92994 677 aa15.92■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 JAK2O60674 1132 aa15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 PDCP20941 246 aa15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 DDB1Q16531 1140 aa15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 CNNM1Q9NRU3 951 aa15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 WNK3Q9BYP7 1800 aa15.91■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 TTLL5Q6EMB2 1281 aa15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 FAM173BQ6P4H8 233 aa15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 RNF214Q8ND24 703 aa15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 E7EWF7 191 aa15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 PDE8AO60658 829 aa15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 FGD1P98174 961 aa15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 WASHC4Q2M389 1173 aa15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa15.9■□□□□ 0.14
SYCE1-205ENST00000479535 ESPNB1AK53 854 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.2 ms