RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479043.1

ANKRD28-210, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 4

Gene ANKRD28, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-210ENST00000479043 MUC3BQ9H195 1237 aa7.34□□□□□ -1.23
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ANKRD28-210ENST00000479043 FAM20CQ8IXL6 584 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.33□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 TRIM33Q9UPN9 1127 aa7.33□□□□□ -1.24
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ANKRD28-210ENST00000479043 USP17L4A6NCW7 530 aa7.32□□□□□ -1.24
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ANKRD28-210ENST00000479043 GHRHP01286 108 aa7.32□□□□□ -1.24
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ANKRD28-210ENST00000479043 USP17L2Q6R6M4 530 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 USP17L1Q7RTZ2 530 aa7.32□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
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ANKRD28-210ENST00000479043 SOX18P35713 384 aa7.3□□□□□ -1.24
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ANKRD28-210ENST00000479043 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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ANKRD28-210ENST00000479043 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.3□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 WDR64B1ANS9 1081 aa7.29□□□□□ -1.24
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ANKRD28-210ENST00000479043 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.29□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 MMP20O60882 483 aa7.28□□□□□ -1.24
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ANKRD28-210ENST00000479043 COL19A1Q14993 1142 aa7.28□□□□□ -1.24
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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ANKRD28-210ENST00000479043 SEC13P55735 322 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 KLHL23Q8NBE8 558 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 GLMNQ92990 594 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.24□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.24□□□□□ -1.25
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ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 KCNMB2Q9Y691 235 aa7.23□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 FSCN2O14926 492 aa7.22□□□□□ -1.25
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ANKRD28-210ENST00000479043 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 C11orf91Q3C1V1 193 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 ATG3Q9NT62 314 aa7.22□□□□□ -1.25
ANKRD28-210ENST00000479043 F13BP05160 661 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-210ENST00000479043 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-210ENST00000479043 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-210ENST00000479043 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-210ENST00000479043 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD28-210ENST00000479043 CDC27P30260 824 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-210ENST00000479043 ZNF124Q15973 351 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-210ENST00000479043 RGL4Q8IZJ4 473 aa7.2□□□□□ -1.26
ANKRD28-210ENST00000479043 MYO19Q96H55 970 aa7.2□□□□□ -1.26
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