RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477413.1

CNIH4-208, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 4, human

TSL 5

Gene CNIH4, Length 820 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNIH4-208	ENST00000477413	XDH	P47989	1333 aa		28.83	■■■□□ 2.21
CNIH4-208	ENST00000477413	CSF1R	P07333	972 aa		28.82	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	C6orf229	H3BNL8	230 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	GGA1	Q9UJY5	639 aa		28.81	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	SLFN5	Q08AF3	891 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413		A0A1B0GUL6	1792 aa		28.8	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413		F6X3S4	739 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	RAD17	O75943	681 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	UFL1	O94874	794 aa		28.79	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	28.78	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	ECE2	O60344	883 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	CNTROB	Q8N137	903 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	DPF2	Q92785	391 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		28.78	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		28.77	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	MED23	Q9ULK4	1368 aa		28.76	■■■□□ 2.2
CNIH4-208	ENST00000477413	ALDH1L1	O75891	902 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	ATP2B4	P23634	1241 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	28.76	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	CLEC11A	Q9Y240	323 aa		28.76	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	FAM161A	Q3B820	660 aa		28.75	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	PTPRC	P08575	1304 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	GRM8	O00222	908 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	PSMD14	O00487	310 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	RIMBP2	O15034	1052 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	ITGA6	P23229	1130 aa		28.74	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	FOXO4	P98177	505 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	28.73	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	CNTNAP1	P78357	1384 aa		28.73	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		28.72	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	UTY	O14607	1347 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.71	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	DOK7	Q18PE1	504 aa		28.71	■■■□□ 2.19
CNIH4-208	ENST00000477413	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.7	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		28.7	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	28.69	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	MICALL2	Q8IY33	904 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		28.69	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	PODN	Q7Z5L7	613 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	28.68	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		28.68	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413		H7C1D1	291 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		28.67	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		28.66	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	SHTN1	A0MZ66	631 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	RASSF10	A6NK89	507 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		28.65	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	GML	Q99445	158 aa		28.64	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
CNIH4-208	ENST00000477413	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		28.63	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	CHRND	Q07001	517 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	28.62	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	KAZALD1	Q96I82	304 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	COA1	Q9GZY4	146 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		28.62	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413		G3V3G9	751 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		28.61	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	28.61	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	USP17L3	A6NCW0	530 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	USP17L4	A6NCW7	530 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		28.6	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	TRAF5	O00463	557 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	EGFR	P00533	1210 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	28.59	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	CST9	Q5W186	159 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	SUCLG2	Q96I99	432 aa		28.59	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		28.58	■■■□□ 2.17
CNIH4-208	ENST00000477413	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		28.58	■■■□□ 2.17

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