RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473511.5

MIB2-208, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 5

Gene MIB2, Length 1,332 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-208	ENST00000473511	FAM161A	Q3B820	660 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	GGA1	Q9UJY5	639 aa		28.94	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	XDH	P47989	1333 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	ITGA6	P23229	1130 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	28.92	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	TNIP1	Q15025	636 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	DOK7	Q18PE1	504 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	SRCIN1	Q9C0H9	1055 aa		28.92	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	SPEF2	Q9C093	1822 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	ECE2	O60344	883 aa		28.91	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	28.91	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	GRM8	O00222	908 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	CSF1R	P07333	972 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	28.9	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		28.9	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		28.89	■■■□□ 2.22
MIB2-208	ENST00000473511	ALDH1L1	O75891	902 aa		28.89	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		28.89	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	28.88	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		28.88	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511		G3V3G9	751 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	FOXO4	P98177	505 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		28.87	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	PTPRC	P08575	1304 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	28.86	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	PSMD14	O00487	310 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	ATP2B4	P23634	1241 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		28.86	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	PASK	Q96RG2	1323 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	CNTROB	Q8N137	903 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	KLRG1	Q96E93	195 aa		28.83	■■■□□ 2.21
MIB2-208	ENST00000473511	SHTN1	A0MZ66	631 aa		28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	28.82	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	28.81	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	MICALL2	Q8IY33	904 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	SUCLG2	Q96I99	432 aa		28.8	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	SCN9A	Q15858	1988 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	CREBZF	Q9NS37	354 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	MED23	Q9ULK4	1368 aa		28.79	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		28.78	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511		H7C1D1	291 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	CHRND	Q07001	517 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	LEMD3	Q9Y2U8	911 aa		28.77	■■■□□ 2.2
MIB2-208	ENST00000473511	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	28.76	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	TAF7L	Q5H9L4	462 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	DPF2	Q92785	391 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	KAZALD1	Q96I82	304 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	28.76	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		28.76	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	KCNJ4	P48050	445 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	28.75	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	UTY	O14607	1347 aa		28.75	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	KLRK1	P26718	216 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		28.74	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	28.74	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	TAF5L	O75529	589 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	28.73	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	PODN	Q7Z5L7	613 aa		28.73	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	28.72	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	28.72	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	SNAP23	O00161	211 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	TRAF5	O00463	557 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	28.71	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	LDHAL6A	Q6ZMR3	332 aa		28.71	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	USP17L3	A6NCW0	530 aa		28.7	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	USP17L4	A6NCW7	530 aa		28.7	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	EGFR	P00533	1210 aa		28.7	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	28.7	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	28.7	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		28.7	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	USP44	Q9H0E7	712 aa		28.7	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	CNNM1	Q9NRU3	951 aa		28.7	■■■□□ 2.19
MIB2-208	ENST00000473511	JMY	Q8N9B5	988 aa		28.69	■■■□□ 2.18

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.8 ms