RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469744.1

MRPL28-208, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene MRPL28, Length 1,467 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28-208ENST00000469744 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 LINS1Q8NG48 757 aa22.24■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.24■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 GREM2Q9H772 168 aa22.24■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa22.23■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.23■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.23■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.22■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa22.22■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 UFL1O94874 794 aa22.22■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 CASP7P55210 303 aa22.22■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.22■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 DOK7Q18PE1 504 aa22.21■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 BEND3Q5T5X7 828 aa22.21■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
MRPL28-208ENST00000469744 KLRG1Q96E93 195 aa22.2■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 FAM161AQ3B820 660 aa22.19■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 EYA3Q99504 573 aa22.19■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 PODXL2Q9NZ53 605 aa22.19■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.19■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 GGA1Q9UJY5 639 aa22.19■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 PCNTO95613 3336 aa22.19■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 SCN9AQ15858 1988 aa22.18■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 ECE2O60344 883 aa22.18■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 SLC4A10Q6U841 1118 aa22.18■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.18■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.18■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 RTL9Q8NET4 1388 aa22.18■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 PASKQ96RG2 1323 aa22.18■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 SHTN1A0MZ66 631 aa22.17■■□□□ 1.14
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MRPL28-208ENST00000469744 TNIP1Q15025 636 aa22.17■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.17■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 XDHP47989 1333 aa22.17■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 PSMD14O00487 310 aa22.16■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 CNTROBQ8N137 903 aa22.16■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 ITGA6P23229 1130 aa22.15■■□□□ 1.14
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MRPL28-208ENST00000469744 PLIN1O60240 522 aa22.15■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 CRBNQ96SW2 442 aa22.15■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
MRPL28-208ENST00000469744 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
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MRPL28-208ENST00000469744 CSF1RP07333 972 aa22.14■■□□□ 1.13
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MRPL28-208ENST00000469744 CREBZFQ9NS37 354 aa22.14■■□□□ 1.13
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MRPL28-208ENST00000469744 G3V3G9 751 aa22.13■■□□□ 1.13
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MRPL28-208ENST00000469744 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
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MRPL28-208ENST00000469744 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.12■■□□□ 1.13
MRPL28-208ENST00000469744 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.12■■□□□ 1.13
MRPL28-208ENST00000469744 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.12■■□□□ 1.13
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MRPL28-208ENST00000469744 ATP2B4P23634 1241 aa22.11■■□□□ 1.13
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MRPL28-208ENST00000469744 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
MRPL28-208ENST00000469744 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
MRPL28-208ENST00000469744 ALDH1L1O75891 902 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL28-208ENST00000469744 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL28-208ENST00000469744 PSME4Q14997 1843 aa22.1■■□□□ 1.13
MRPL28-208ENST00000469744 TRAF5O00463 557 aa22.09■■□□□ 1.13
MRPL28-208ENST00000469744 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
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MRPL28-208ENST00000469744 JMYQ8N9B5 988 aa22.09■■□□□ 1.13
MRPL28-208ENST00000469744 A0A1B0GUL6 1792 aa22.09■■□□□ 1.13
MRPL28-208ENST00000469744 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.09■■□□□ 1.13
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MRPL28-208ENST00000469744 EGFRP00533 1210 aa22.08■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.08■■□□□ 1.12
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MRPL28-208ENST00000469744 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.07■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 DPF2Q92785 391 aa22.07■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 SUCLG2Q96I99 432 aa22.07■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.07■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 PTPRCP08575 1304 aa22.07■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.07■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 CHRNDQ07001 517 aa22.06■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.06■■□□□ 1.12
MRPL28-208ENST00000469744 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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