RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468077.5

TARBP1-204, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene TARBP1, Length 514 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-204ENST00000468077 DOK7Q18PE1 504 aa20.29■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 FAM89AQ96GI7 184 aa20.29■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.28■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa20.27■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 TBC1D16Q8TBP0 767 aa20.27■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 CDCA5Q96FF9 252 aa20.27■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.27■□□□□ 0.84
TARBP1-204ENST00000468077 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa20.26■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 G3V3G9 751 aa20.26■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 TMPOP42166 694 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 KRT24Q2M2I5 525 aa20.26■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.26■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.26■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa20.25■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.25■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 CSRNP1Q96S65 589 aa20.25■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 ZNF609O15014 1411 aa20.25■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 UFL1O94874 794 aa20.24■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.24■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 PSME4Q14997 1843 aa20.23■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.23■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa20.23■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 HOXB7P09629 217 aa20.22■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 FKBP1BP68106 108 aa20.22■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 GGA1Q9UJY5 639 aa20.22■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 CHL1O00533 1208 aa20.21■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 SCARF1Q14162 830 aa20.21■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 NEUROD2Q15784 382 aa20.21■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.21■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 HYPKQ9NX55 129 aa20.21■□□□□ 0.83
TARBP1-204ENST00000468077 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.2■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.2■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.19■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.18■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.18■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 USP17L8P0C7I0 530 aa20.17■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 GOLGA2Q08379 1002 aa20.17■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.17■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 CCDC146Q8IYE0 955 aa20.17■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 XDHP47989 1333 aa20.17■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.16■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
TARBP1-204ENST00000468077 USP17L3A6NCW0 530 aa20.14■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 USP17L4A6NCW7 530 aa20.14■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 RALBP1Q15311 655 aa20.14■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 DUSP27Q5VZP5 1158 aa20.14■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 MOB2Q70IA6 237 aa20.14■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.14■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 GMLQ99445 158 aa20.14■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 TRIM35Q9UPQ4 493 aa20.14■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 TBC1D8O95759 1140 aa20.13■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 UBE2Q2LH0YL09 131 aa20.12■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 NF2P35240 595 aa20.12■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 PODNQ7Z5L7 613 aa20.12■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.12■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 RUNDC1Q96C34 613 aa20.12■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 MYD88Q99836 296 aa20.12■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 PDE8AO60658 829 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 ATP2B4P23634 1241 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 CCDC191Q8NCU4 936 aa20.11■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 MED23Q9ULK4 1368 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 SREBF2Q12772 1141 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 OGFOD1Q8N543 542 aa20.1■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 SPEF2Q9C093 1822 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 GPR25O00155 361 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 NBPF9Q3BBW0 867 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 MBIPQ9NS73 344 aa20.09■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 FBXW7Q969H0 707 aa20.08■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
TARBP1-204ENST00000468077 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms